治肛周囊肿大约需要7-10天的时间。多数需要手术切开脓肿，充分引流脓液，防止其不断扩散，以减轻疼痛等症状。伴有肛瘘的肛管直肠周围脓肿，要治疗必须先处理肛瘘，局部可用中药的溶液坐浴，使会阴保持清洁。同时应用抗生素控制感染。
肛周脓肿是与局部摩擦损伤或卫生不好，细菌感染等引起的，中医治疗需要扩创引流配合药物治疗，注意患处卫生，避免挤压，尽快去医院扩充引流，引流后按时换药，预防肛瘘形成。不要久站久坐，要多做一些有益的运动，特别是提肛运动。
服用药物治疗肛周脓肿时，一些药物和一些饮食是不能同时吃的。如在服用清热解毒剂时，应该忌吃鱼、虾、羊肉、香菜、韭菜等，竹笋、狗肉、海鲜等食物也不要吃。绿豆粥，主料：大米250克，绿豆150克，白砂糖200克，常用水适量。做法：1.将大米用清水淘净；绿豆去杂质，用清水洗净。
首先做肛诊检查看一下脓肿的程度，如果脓肿很大，周围肿胀疼痛应该及时的手术彻底切开脓肿充分清理冲洗脓液引流才能很快好转的。除非很小的脓肿可以服用抗生素消炎。可以逐渐恢复正常的。
低位的肛周脓肿术后刀口完全愈合需要一个月左右，期间要经常换药，要安排好时间。一般是术后一周多要每天便后换药，以后可以隔天一次，再以后隔两天一次，间隔时间根据刀口愈合情况而定。以确保刀口顺利愈合，预防肉芽组织增生过长或者肛门狭窄等情况发生。
