在大便时，肛门口灼痛，因分泌物刺激，肛门周围表皮脱落，有时成裂口发痒，下腹部胀满不适，食欲不振，体重减轻，全身不适。急性直肠炎长期不愈，则变为慢性直肠炎，直肠粘膜及其下层肥厚者，为慢性肥大性直肠炎，直肠内的肠腺在炎症得不到治疗的状况下回形成萎缩性直肠炎。
异物的损伤，是最常见的病因，一些不消化的异物可以引起直肠粘膜的损伤的，从而导致直肠炎。良性肿瘤恶变，也可以引起直肠炎，比如一般的直肠家族性息肉可以恶变。饮食的原因，高脂肪、高蛋白或者是低纤维素的饮食，与直肠炎的发病有明显的关系。有毒的化学品，比如各种杀虫剂不小心服下以后可以导致直肠粘膜的损伤，引起直肠炎。
造成直肠炎的原因有慢性炎症的刺激：长期的慢性炎症可能是引起肛门直肠炎的要素。如慢性细菌感染、阿米巴痢疾、慢性非特异性结肠炎、憩室炎等，使得粘膜发生肉芽肿、炎性变和假息肉阶段而发生炎变。
性炎症的刺激：长期的慢性炎症可能是引起肛门直肠炎的要素。如慢性细菌感染、结肠炎、憩室炎等，使得粘膜发生肉芽肿、炎性变和假息肉阶段而发生炎变。良性肿瘤恶变：直肠腺瘤、乳头状瘤。
直肠炎不治疗会导致肠息肉和结肠癌等。结肠炎超过五年，肠道溃疡面在炎症的长期刺激下容易异常增生，引发肠息肉，一厘米以上肠息肉癌变率极高；另外，约5%肠炎病例可发生癌变，多见于病变累及全结肠，幼年起病和病史超过10年者。