一般情况下，专业治疗毛囊炎的方法有药物治疗、物理治疗等，具体内容如下：
对于毛囊炎初期未化脓者，可以外用碘酊，也可以外用百多邦软膏、夫西地酸乳膏等。口服的抗生素有青霉素类，头孢类，大环内酯类，也可以根据药敏试验来选择。在临床上，需要结合免疫调节剂（转移因子口服液）来进行治疗。在疾病初期可以使用物理治疗，如超短波、远红外、紫外线等物理治疗。
引起毛囊炎的病原菌主要是金黄色葡萄球菌，偶有表皮葡萄球菌、链球菌、假单孢菌属和类大肠杆菌。毛发的牵拉、摩擦、搔抓引起的损伤都有可以引起毛囊炎，病人可以使用一些药物进行治疗。
出现了毛囊炎之后，是不再进行运动出汗的，因为在运动的过程中出汗的情况下，还是很容易的引起毛囊炎的再次感染，同时还是很容易导致毛囊炎的症状严重的，所以还是需要十分的注意的。
毛囊炎需要忌口，忌口跟局部炎症刺激有关系，吃辛辣刺激的东西，会促进炎症物质的释放或者产生，这样就会症状就会加重。忌口主要是体质，当然主要是热，热有两种一个是内热，一个是外热。外热比如说环境，高温，潮湿，或者是干燥这种环境容易得毛囊炎；内热比如熬夜，吃东西不规律，容易得毛囊炎。忌口吃辛辣刺激，肥肉甜食的食物。
毛囊炎是整个毛囊细菌感染发生化脓性炎症。主要病原菌为葡萄球菌。诱因有不清洁、搔抓及机体抵抗力低下等。好发生于头部、前胸、后背等。
毛囊炎的表现起初为与毛囊口一致的红色充实性丘疹或由毛囊性脓疱疮，然后迅速发展演变为丘疹性脓疱，中间贯穿毛发，干燥结痂，经一周的时间痂皮脱落而愈，有的可反复发作多年不治愈发现毛囊炎应该及早进行抗感染治疗，注意保持皮肤的清洁。