一般情况下，新生儿衣原体感染会有呼吸道症状、结膜不适等症状表现。
1、呼吸道症状：新生儿衣原体感染主要出现呼吸道症状，如发热、咳嗽、咳痰、咽部不舒服、重症肺部感染，也可能出现呼吸困难和呼吸衰竭。
2、结膜不适：结膜分泌物初为浆液性，很快变成脓性，眼睑水肿明显，结膜充血显著并增厚，严重的可能也会影响视力。
女性衣原体感染症状通常有尿频、尿急等。
在出现衣原体感染的情况时，主要是由泌尿生殖系统引起的，女性常见的是宫颈炎、盆腔炎等妇科炎症，会出现尿频、尿痛等表现，还可能有白带增多、阴道黏膜异常、宫颈水肿等症状。如果累及呼吸道，可能出现咳嗽、咳痰等表现。
感染后，女性要积极治疗，注意休息，不要熬夜。
衣原体感染症状会因累及部位不同，出现发热、尿痛等症状。
衣原体是一种革兰阴性病原体，为具有独特发育周期的原核细胞性微生物。若是累及呼吸道，可出现发烧、乏力、鼻塞、流鼻涕、咳嗽、呼吸困难、喘息、胸痛等症状。若是引起泌尿系统感染，可表现为尿频尿急、排尿不畅、尿痛、分泌物等。
男性衣原体感染在临床上较为多见，其表现具体分析如下：
1、尿路刺激的症状：比如尿频，尿急，尿痛，尿道瘙痒等。
2、尿道外口分泌物：衣原体感染时，尿道口可有白色分泌物，晨尿时较为明显。这些分泌物呈尿道口不自主外溢，若伴有其他细菌感染时，可呈乳白色或浅黄色，质地黏稠。
3、其他症状：有的病人分泌物并不明显，但可能会出现尿道外口瘙痒或发炎，或者内裤上有污斑和污渍。
肺部衣原体感染的表现为高热，恶心，呕吐，并伴有精神不振，头痛和咳嗽。
肺部衣原体感染属病原微生物的感染，多由长期营养不良或免疫功能低下所致，且年老体弱者患病的可能性较多。
衣原体感染后，易导致咽炎和扁桃体炎症的发生，严重者可蔓延至呼吸道，因而很可能导致高热和恶心、呕吐，还有精神萎靡，头疼，咳嗽。
妇科衣原体感染有白带异常、阴道流血等症状。
1、白带异常：女性生殖系统感染衣原体后，炎症刺激会使白带的分泌增加，并且会有异味。病情较重的患者可有脓性分泌物、粘液或浆液分泌物等。
2.阴道流血：衣原体感染后，宫颈粘膜会出现充血、水肿，尤其在同房的时候，经常会因为反复的摩擦而出现局部溃破、出血。