疱疹性咽峡炎要发烧3天-6天左右。疱疹性咽峡炎是由肠道病毒引起的，属于呼吸道传染性疾病，是病毒感染导致的一种疾病，具有传染性，与手足口病类似，以急性发热和咽峡炎部的疱疹、溃疡为特征。
一般病程3-5天后体温就逐渐正常了，预示着疱疹性咽峡炎马上就恢复了。疱疹性咽峡炎主要是带状疱疹病毒感染引起来的上呼吸道炎症，主要以咽峡部局限性炎症为主。咽痛、发热以及咽峡粘膜疱疹的表现。根据病毒感染的强弱以及患儿体质的不同和疾病进展，体温是随时波动的。一般早期炎症反应期会出现发热、甚至是高热，随着病毒毒素反应的减弱以及病情的好转，体温会逐渐的恢复正常。
一般是一周左右，因为每个人的身体状况不同，所以具体发烧多长时间不是固定的，一般与着凉和病毒感染有很大的联系，要尽早服用抗病毒类的药物，注意口腔卫生，注意居住环境通风，勤洗手，多喝温开水，不吃辛辣刺激性饮食。
可能是发生后体内缺水引起的刺激性咳嗽，疱疹性的咽峡炎也会出现咳嗽，只是咳嗽的症状并不是很严重，可以口服消炎药来治疗，如果出现白细胞的升高，说明合并细菌性的感染。
在积极抗炎治疗三天左右，患者发热的情况会消退，可以用温毛巾擦身体，同时配合冰袋进行冷敷额头。生活中应该多锻炼身体，增强自己的抵抗能力，不要总是受凉，避免引发咽峡炎。
疱疹性咽峡炎主要的症状是咽部疼痛、吞咽困难，有的会伴有高热的情况。在疱疹期间，如果出现持续发烧的情况，患者首先可以采用物理降温的办法，可以用温毛巾擦拭身体，同时也可以用冰袋冷敷额头、双侧颈部。在此期间患者一定要多喝水，必要的时候，退热药治疗。