一般情况下，肠炎发烧当患者体温不超过38.5℃时，可用温水擦拭四肢、腋窝、腘窝、腹股沟等部位进行降温。
然后需要临床应用药物给予对症治疗。用的药物包括抗炎药物，如喹诺酮类的左氧沙星，以及头孢类的头孢他啶等。治疗期间患者要注意戒烟戒酒，不要吃辛辣、刺激、油腻的食物，以免影响药物的吸收，不利于疗效的发挥。
一般情况下，宝宝肠炎发烧，需要根据病情原因来进行治疗，具体分析如下：
肠子感染造成的炎症反应，如果体温没有高于38.5度，说明孩子的心理状况良好，可以考虑用原发性肠炎进行治疗。要针对具体的病情选用适当的抗生素进行抗感染的处理。感染得到了有效的控制，身体的温度也会恢复到正常水平，但是如果孩子的情绪很差，或是因为肠道炎引起的腹泻，出现了大量的腹泻，那么要注意调节体温及时输液，避免出现脱水和高温惊厥的情况。
可以服用药物后会退热，但是还容易反复应该及时到医院进行血常规以及相关检查，明确发热的病因，然后有针对性的采取有效的药物进行治疗，以免延误病情给孩子身体造成不利影响。
肠胃炎发烧期间，需要增加维生素的补充，而新鲜的水果、蔬菜中含有较多的维生素，如：胡萝卜、菠菜、芹菜、南瓜等含维生素A较多；西红柿、柿子、苹果、芥菜等含维生素C较多。适当的食用作用好。此外，多吃稀粥、菜汤、水果汁等食物，不但易消化、营养丰富，还可以补充足够的水分和足够的热量，适合肠胃炎发烧病人食用。
是因脾胃湿热导致的清气不能上升、浊气不能下降引起的腹胀不适症状，药物治疗并不理想。中医中药长期临床实践积累了许多非常有效的治疗方法，采用传统中药治疗。这些药物配合使用可以彻清除脾胃湿热，增强胃肠功能，促进胃肠蠕动，快速修复胃肠粘膜，荡涤胃肠浊气。
