抗抑郁药副作用可能会有口干、便秘、心动过速、视物模糊、震颤、体位性低血压、嗜睡、体重增加等。然后还有可能会出现焦虑、烦躁不安，食欲增加或降低、体重增加，多汗，关节疼，性功能障碍等。
抗抑郁药起效需要等待一段时间，一般是1-3周能够见到效果。在临床上，主要从症状出现频率有无减少和严重程度有无变化来评价有无改善。不管是频率少了，还是程度轻了，都认为药物开始起效。患者常常能够自己感觉到情绪较前改善，能够高兴起来，脑子反应也不再那么慢，也能够对事物提起兴趣，愿意与人交流沟通，身体疲乏的感觉也少了。
服用抗抑郁药期间不可以怀孕，新生儿会出现适应困难、呼吸困难、喂养困难、易激惹等，但大多不严重，通常短期内会消失，若孕妇抑郁症状严重不宜轻率撤药，要注意定期做好产前的各项检查，明确胎儿发育的具体情况。
鉴别药物不良反应与抑郁症状非常重要，如疲劳及对碳水化合物的渴求等。鉴于大部分不良反应为一过性，当其出现时，观察性等待往往是合理的选择。换药之前，可以首先尝试降低药物剂量或调整服药时间。若效果欠佳，联用其他药物也可以考虑。
抗抑郁药治疗早泄的剂量应该比治疗抑郁症小。抗抑郁的药有镇静的作用，能够调节神经，但是早泄虽然是由于神经功能失调产生的，抗抑郁药不仅在大剂量使用时可以引起抽搐发作，有时治疗剂量也会引起抽搐发作。如果想要治疗早泄，可以口服一些专门的调节神经的药物和维生素类的药物。
抗抑郁药要在服用1-2周后逐渐起效，顺利的情况下，在服用6-8周后病情会明显好转或基本恢复到正常状态。了解抗抑郁药这种起效相对较慢的特点，能否坚持服药很重要。如头晕头昏甚至头痛不适、恶心胃胀等胃肠道症状都是比较常见的反应，此时有些患者的体验可能是，抗抑郁药不吃还好，吃了病情反而更重了，此时就很容易自行停药，这样后续治疗就很难进行。