药流后清宫可能会对子宫造成二次伤害，主要发生在操作过程中。药流清宫手术过程中，很容易损伤子宫内膜基底层，导致清宫过后子宫内膜修复困难，甚至是出现子宫内膜粘连，或者引起宫腔内的感染。部分人群可能会导致子宫穿孔等严重并发症。建议女性不要轻易选择药物流产，必要时直接选择人工流产。药流后一个月内避免盆浴，不要做阴道冲洗或游泳，以防感染。在月经再次来潮之前，禁止性生活。
药流不全两年没清宫，可能会出现宫腔粘连的现象。因为药物流产不能持续太久，所以可以通过定期的子宫内膜剥离，将残余的蜕膜排出体外，恢复子宫的功能；另一方面，药物流产不彻底，造成内膜粘连，可能hi出现继发性感染，也有可能引起不孕。因此，如果有这样的症状，最好是去做B超，检查一下子宫内部的状况，然后才能进行治疗。
药流流不干净，如果不行清宫，要根据残留物的大小来决定。如果是残留物在1厘米以内，并且没有出血，可以不需要清宫，如果是残留物超过厘米，并且出血比较多，必须要清宫，如果不清宫，有可能会出现大流血或者宫腔的感染和宫腔粘连，就可能造成以后的永久性不孕症。
一般来说，药流残留30mm不清宫，会引起炎症、宫腔粘连等。
如果身体吸收了这些残留的物质，会产生一些对患者的凝血功能不正常的物质。另外，如果体内的组织结构经过长时间的机化，要刮宫，不一定能刮掉，甚至需要进行电切，这样会增加手术的难度；如果它们还活着，在身体里不断的增殖，就会引发一种叫做营养细胞的恶性疾病。
清宫可能对宫颈造成一定的刺激以及对子宫内膜等可能造成一定的损伤，但是相对于宫内残留带来的影响可能加大。清宫术后要注意休息半个月，必要时候需要进行抗炎治疗。平时要注意采取正确的方式避孕。
药物流产能够完全排出孕囊，但是还有蜕膜，即是没有排出的子宫内膜，可以通过清宫将蜕膜清出，从而降低不全流产的几率。药物流产后宫颈口松弛，吸管不需要扩大宫颈口，可以缩短手术时间，减少宫颈的刺激。孕妇最好是在妊娠50天到3个月之间。直接人工流产是用吸管一点一滴的将孕囊吸出来，因为吸管会留下一些不干净的痕迹，宫颈的位置比较窄，所以需要一定的时间来扩大宫颈管。
