婴儿腹泻腹疼可以药物治疗，病毒以及非侵袭性细菌所致肠炎可不使用抗生素。对于病毒感染所致的肠炎，抗生素并无效果。寄生虫感染所致肠炎需使用抗寄生虫药物。可酌情选用胃肠道黏膜保护剂及微生态疗法。
宝宝腹泻腹胀应该给宝宝正常的饮水。因为腹泻的时候，大部分水分会通过大便排出体外，容易产生脱水和电解质丢失。如果宝宝腹胀明显，可以给宝宝进行腹部按摩，顺时针方向，用掌心或者是拳头。
化不良引起胀气、腹泻,这是消化不良很正常的一种症状。消化不良主要是由于胃动力不足或者为动力出现了障碍,这些障碍也包括了为蠕动功能不足造成的。
胃肠功能失调会导致腹胀、腹泻、嗳气、消化不良等症状，可以服用乳酸菌素片、益生菌等。除了要用药外，还要避免吃辛辣刺激性的食物，避免食用过多的寒凉生冷的食物，少吃油腻和油炸的食物，多喝小米粥，多吃烂面条，拉肚子的时候可以多喝糖和盐水，一日三顿按时定量。
检查化验大便是因为消化不良还是因为肠炎，同时在此期间要多喝温水，不吃凉的不易消化的东西，顺时针给按摩肚子，促进肠胃蠕动，可以很好的缓解腹胀的现象。同时母乳喂养的宝宝也要注意妈妈的饮食。
属于小儿腹泻，检查化验大便是消化不良还是肠炎，还要注意是否是有感冒导致的肠功能紊乱，休息。多喂水，如果再添加辅食应该暂停添加.或减少辅食添加，好转后再循序渐进恢复，尤其不要吃不消化的食物。