曲霉菌感染的话主要治疗是抗真菌治疗。在医生的指导下使用药物进行治疗，然后在一周的时间去医院检查一下，看一下有没有好转的情况。平时注意自己的个人卫生，注意饮食摄入。
曲霉菌感染人体可引起变态反应综合征和侵袭性感染，可侵犯人体皮肤、黏膜、大脑、眼睛等全身各组织器官。治疗曲霉菌感染的药物是，其中首选药物为伏立康唑，疗程至少在6-12周；也可选择伊曲康唑、泊沙康唑、两性霉素b、卡泊芬净及米卡芬净等。抗曲霉治疗多以单药治疗为主，但对于单药治疗失败或无法耐受感染的患者，可选择两种作用机制不同的药物联合治疗，联合治疗可发挥药物的协同或加强作用其疗效比单药治疗可明显更强。
烟曲霉菌是一种真菌，是一种曲霉。其致病力与其分泌的一些致病性相关，如烟曲霉素、烟曲霉酸、内毒素等。目前临床上使用的抗真菌药物对烟曲霉菌的治疗效果并不是很好，目前主要用于烟曲霉菌的初期治疗，对于不能耐受或者不能耐受的患者，可以采用伊曲康唑、卡泊芬净、米卡芬净等药物进行补救。在临床上，要针对不同部位的烟曲霉菌进行相应的治疗，而对烟曲霉菌则要足量、足疗程，避免病情反复。
烟曲霉菌属于子囊菌类，通过释放无性孢子进行传播，侵入人体后可以随时引起感染，临床上常见的为支气管肺病等多种呼吸疾病。一旦存在烟曲霉感染，治疗的时间比较长。同时烟曲霉感染属于真菌侵入感染，可以服用抗真菌药物。
曲霉菌感染即属于真菌感染，如果确诊后是需要加强抗真菌以及抗炎治疗的。需要的药物需要很敏感，常用于氨曲南，这种药物一般是比较贵同时也很稀缺，在三甲医院才有的。如果是侵袭性真菌感染的死亡率可以达到60%到70%，一般可以持续时间是在半个月左右，确诊后需要积极对症，以维持生命征为主。
部分患者出现肺部曲霉菌感染的情况，可能无症状，或者有咳嗽、发热、胸痛、咯血等早期症状，随并且发展，可出现全身不适、体重减轻的情况。曲霉菌感染引起急性侵袭性肺霉菌病，临床症状一般常有气促和低氧血症，此时患者的胸部影像学检查的表现多种多样，部分患者可出现相对特征性表现，可提示诊断，但部分患者的影像学检查可能无确诊价值，因为其它感染和非感染性疾病也可有类似表现，不同类型侵袭性肺曲霉菌病的危险因素，影像学表现不同，但诊断原则和治疗方法基本一致。患者应摆正心态，正确认识疾病并积极就医诊治。
