黄曲霉菌中毒前驱表现为发烧，腹痛，呕吐，食欲减退等。晚期症状有肝脏肿大，肝区疼痛，黄疸，脾大，腹水，下肢浮肿及肝功能异常。可有心脏扩大，肺水肿，甚至痉挛，昏迷等，多数病人在死前可有胃肠道大出血表现。
黄曲霉素毒性远高于氰化物、砷化物、有机农药等的毒性，其中以其中的B1毒性最大。B1的多致死量为0.24-0.32毫克/千克.体重，属特别剧毒的毒物范围。另外黄曲霉素含量只要在30-50微克/千克为低毒，50-100微克/千克就为中毒，100-1000微克/千克就是高毒。
不同类型的肺曲霉病有不同的临床表现。侵袭性肺曲霉病的特点是发热、胸痛、咯血等。慢性曲霉病一般不发热，曲霉球常无症状，ABPA可有严重喘息、缺氧等。空洞结节影，但部分肺曲菌病患者表现为楔形实性影、中央支气管扩张伴粘液血栓形成等，因此其特点并不绝对。发病时CT表现典型的是早期炎性阴影，周围有雾状渗出物，炎性病灶伴有腔内实变，可见支气管扩张征象。
烟曲霉菌是一种真菌，是一种曲霉。其致病力与其分泌的一些致病性相关，如烟曲霉素、烟曲霉酸、内毒素等。目前临床上使用的抗真菌药物对烟曲霉菌的治疗效果并不是很好，目前主要用于烟曲霉菌的初期治疗，对于不能耐受或者不能耐受的患者，可以采用伊曲康唑、卡泊芬净、米卡芬净等药物进行补救。在临床上，要针对不同部位的烟曲霉菌进行相应的治疗，而对烟曲霉菌则要足量、足疗程，避免病情反复。
曲霉菌感染人体可引起变态反应综合征和侵袭性感染，可侵犯人体皮肤、黏膜、大脑、眼睛等全身各组织器官。治疗曲霉菌感染的药物是，其中首选药物为伏立康唑，疗程至少在6-12周；也可选择伊曲康唑、泊沙康唑、两性霉素b、卡泊芬净及米卡芬净等。抗曲霉治疗多以单药治疗为主，但对于单药治疗失败或无法耐受感染的患者，可选择两种作用机制不同的药物联合治疗，联合治疗可发挥药物的协同或加强作用其疗效比单药治疗可明显更强。
部分患者出现肺部曲霉菌感染的情况，可能无症状，或者有咳嗽、发热、胸痛、咯血等早期症状，随并且发展，可出现全身不适、体重减轻的情况。曲霉菌感染引起急性侵袭性肺霉菌病，临床症状一般常有气促和低氧血症，此时患者的胸部影像学检查的表现多种多样，部分患者可出现相对特征性表现，可提示诊断，但部分患者的影像学检查可能无确诊价值，因为其它感染和非感染性疾病也可有类似表现，不同类型侵袭性肺曲霉菌病的危险因素，影像学表现不同，但诊断原则和治疗方法基本一致。患者应摆正心态，正确认识疾病并积极就医诊治。