3个月宝宝腹泻可遵医嘱口服肠道益生菌、蒙脱石散治疗。
3个月宝宝腹泻与肠道菌群失衡有关，调节肠道菌群失常，家长可以在医生指导下给宝宝口服肠道益生菌。口服益生菌能够提高肠道抵抗力，增加肠道中有益菌的存在，促进肠道功能恢复，缓解腹泻，提高宝宝的免疫力。
腹泻比较严重的患者适当服用蒙脱石散，可以吸附肠道中的病毒和细菌，改善肠道细胞的吸收和分泌功能。
进行针对性治疗当小孩身体出现消化不良引起腹泻的病变情况，可以通过消食口服液，清热颗粒等药物，进行规范性治疗。可以给宝宝做腹部热敷，注意腹部保暖，给宝宝服用点药物，也可以带宝宝去医院的儿科就诊，查明病因以后再进行治疗。
通常情况下，5个月婴儿腹泻，家长可以通过使用药物、日常护理等方式进行治疗。具体情况分析如下：
使用药物：5个月婴儿腹泻，家长可以按照医嘱给5个月的婴儿使用藿香正气滴丸、止泻保童颗粒、胃肠安丸等药物进行治疗。
日常护理：5个月婴儿腹泻，家长应注意及时给婴儿添衣，多给婴儿喝水，注意保持婴儿的房间温度适宜，顺时针按摩婴儿的腹部，以促进婴儿身体的恢复。
婴儿长期腹泻要注意饮食，如果是母乳喂养，继续母乳喂养，采取少量多餐，但是母乳间隔的时间一定要适当的缩短，如果是奶粉喂养的宝宝可以用稀米汤或者是白开水稀释牛奶。如果是添加辅食期间可以适当的少添加辅食。而且一定要注意保暖。关键是补液治疗，轻度，中度脱水，需要补充盐水，公斤体重50到80ml。如果是重度脱水，那就要采取输液治疗，按公斤体重90到120ml来计算。
应该注意儿童腹泻，主要是由于病毒感染引起水样便的可能性。根据医生的调理建议，适当使用马脉，适当外用脐贴，有明显的止泻作用。在不久的将来还应该注意食品卫生，应该给婴儿更多的水来观察它是否得到缓解。如果症状变得更严重，有必要立即去看看。