一般情况下，婴儿鼻炎每天凌晨三点咳嗽几声可能是以下原因引起的。具体分析如下：
小儿的鼻炎在凌晨出现咳嗽，很有可能是因为婴幼儿的过敏性鼻炎。也有一些原因是因为婴幼儿的急性鼻炎，这是因为病毒感染所致的鼻粘膜的急性炎性病变，会出现发热、鼻塞、流鼻涕等情况。当鼻液逆向流入咽喉时，会对咽喉粘膜造成一定的刺激，会导致咳嗽等。宝宝早上出现剧烈的咳嗽，也是因为孩子的胃内容物倒灌到了咽喉，会对咽喉粘膜造成一定的刺激。
孩子偶尔咳嗽需要了解咳嗽的原因，有时候孩子喂奶太多引起吐奶，咽喉部出现奶液刺激引起咳嗽或者是天气干燥引起的咳嗽，这些原因给孩子适当的进食些水，可以缓解，但如果长期是这样的话，可以到当地正规医院进行检查做治疗。
孩子连续咳嗽5次以上的，就考虑肺部感染或者是感冒引起的咳嗽。如果是偶尔咳嗽一下，这个没什么问题，如果是感冒引起的，可以吃一点感冒药和消炎的药治疗，如果连续咳嗽的话，还可以喂一点止咳化痰的。
三个月的宝宝咳嗽期间需要尽量注意保暖，多喝开水，这样能够减轻咳嗽的现象，咳嗽不严重的时候不需要用药物治疗，如果咳嗽特别严重的时候，可以适量的吃点润肺止咳化痰的药物治疗。
现在所处的环境空气污染比较严重，每天会咳嗽几声，有可能是呼吸道在做自我清扫的工作，可以视为正常。也有可能是人体在外出之后突然转换环境受到空气刺激产生的咳嗽。如果还伴有咽喉肿痛，发痒等情况则大概率考虑为慢性咽炎，扁桃体炎，支气管炎等，需要及时到呼吸科做相关检查来确诊。
三个月宝宝偶尔咳嗽几声，可能是感冒、急性支气管炎、呛奶等原因导致的。
1.感冒：三个月宝宝如果穿衣服过少，可能会导致受凉容易诱发感冒，从而引起偶尔咳嗽几声，还会伴有鼻塞、流鼻涕、打喷嚏等症状。
2.急性支气管炎：如果三个月宝宝患有急性支气管炎，病情比较轻微，症状也可能会比较轻微，出现偶尔咳嗽几声的情况。
3.呛奶：如果三个月宝宝吃奶过急，可能会发生呛奶，从而引起偶尔咳嗽几声。
