卵巢子宫内膜异位囊肿又名卵巢巧克力囊肿，也是较为常见的卵巢囊肿。是由于子宫内膜异位波及卵巢，在卵巢内形成巧克力样粘稠液体的囊肿。病人常有进行性加重的痛经、性交痛、不孕以及月经失调。巧克力囊肿可采用药物或（和）手术治疗（保守性或治疗性）。迄今为止，除治疗性手术外，尚无一种理想的治疗方法。
导致水肿。卵巢囊肿病患除了能感觉到食欲不良、体重减轻和腹部肿胀之外，还可能引起呕吐、发烧和腹部剧痛；后期甚至会导致腹部与四肢发生水肿。危害，发生癌变。卵巢囊肿增大极易发生感染、扭曲、出血或爆裂，给病患带来生命的威胁。有些肿瘤性的囊肿甚至会发生癌变。
组成针对这一疾病治疗的特色方案--俞氏内异方组，内服、灌肠、局部冷热敷贴等内外治结合。可在消除或控制包块生长的同时，提高而不是抑制病人的卵巢功能，同时能够调节病人卵巢轴功能，使病人体内适合囊肿生长的环境得到纠正，来防止复发的风险。而且对于不孕病人和从保护病人生殖健康的角度看是有意义的，在治疗期间病人的卵巢功能并不会因用药而受到抑制，相反可能有改善作用，这对卵巢的排卵功能、受孕能力等都是有益的。
采用微创手术治疗较彻底，卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，会导致痛经，月经不调，影响怀孕，如果应用药物治疗有明显的见小可以再应用一段时间，如果不好建议还是采用微创手术进行治疗较好，不会影响生育问题。
B超发现卵巢囊肿，一定要医生当时明确告知囊肿是良性还是恶性，是否诊断卵巢巧克力囊肿，这是不现实的，b超可判定盆腔是否有囊肿，囊肿位置及囊肿内部结构，但不能诊断子宫内膜异位症。因为子宫内膜异位症有时很难与卵巢恶性肿瘤、结核病和炎性肿块区分开来。
巧克力囊肿，会引起痛经，痛经是子宫内膜异位最明显的症状，容易忽略的先兆。夫妻生活会伴有点状出血。会引起不孕症状月经不调内异症常有月经周期缩短、经量增多或经期延长等现象，还会引起月经不调。