手上长的扁平疣可以用电灼、激光去除，也可以外涂一些软膏进行治疗，还可以口服一些抗病毒提高免疫力的药物，这个病是病毒感染所致，有传染性而且会自我接种，所以平时避免搔抓疣体。
扁平疣，在中医学中称“扁瘊”，它的病原体和寻常疣一样，都是人乳头瘤病毒，但是病毒亚型不同。扁平疣好发于青少年，又称青年扁平疣。多发于颜面、手背及前臂等处，表现为正常皮色或浅褐色，约2-4毫米直径或稍大的圆形、椭圆形或多角形扁平丘疹，表面光滑，境界明显。一般无自觉症状或偶有微痒。
扁平疣是可以用激光来进行手术的。激光手术后可以彻底的治疗。手术后一定要注意护理，不要让皮肤受到感染。平常要多增加一些身体的锻炼，来提高身体的免疫力。但是一定要选择去正规的医院进行治疗。那里的医疗条件比较好对自身也是一种保障。
可以选择口服抗病毒的药物来进行治疗，或者选择激光来进行治疗症状的，要选择正规的医院，同时要注意术后的护理，做好消毒，以免落下疤痕，不利于皮肤的恢复，注意饮食习惯，不要吃有刺激性的食物为好的。保持皮肤的清洁。
扁平疣如果不是在急性爆发期，而是处于静止期，或者是疣体不算太多的情况下，激光治疗是很好的选择，一般选用点阵激光对疣体进行直接的去除等到皮损干痂脱落病情基本上就好了，但扁平疣很大一部分人容易反复发作，所以激光需要多次的治疗。