常见原因是泌尿系统疾病，大部分原因主要是由于泌尿系统疾病引起的，如肾小球疾病、间质性肾炎、尿路感染、泌尿系结石、泌尿系肿瘤、多囊肾等。还有全身性疾病，如感染性疾病、血液性疾病、自身免疫性疾病、心血管疾病。由尿路邻近器官的疾病造成的，如前列腺炎盆腔炎、宫颈炎、结直肠炎。
血尿多半是由于泌尿系本身疾病所致，其中以肾小球疾病，肾囊肿、结石前列腺增生、尿路感染性疾病及肿瘤最为多见。其他如凝血异常，血小板减少、血友病、坏血病，全身性疾病也可引起血尿。
血尿是由尿路邻近器官的疾病造成的。如前列腺炎盆腔炎、宫颈炎、结直肠炎。还有化学物品或者药品损害，比如磺胺类、避孕药、重金属、环磷酰胺、抗凝剂等造成的。另外，还有一种是功能性的血尿。
血尿的原因有很多种，主要为各种肾小球的疾病引起的肾小球源性的血尿。还有泌尿系统的疾病，如结石、肿瘤、泌尿系感染、血管损伤或先天畸形等。全身性的疾病，例如血液系统的疾病、感染性的疾病和风湿免疫性的疾病，都可导致血尿的发生。
产生血尿的原因很多但主要由泌尿系统疾病引起如肾结核、肾炎、尿路感染、尿路结石血尿同时伴有较长期的尿频、尿急、尿痛者以肾结核的可能性较大，如血尿伴眼睑、面部或全身浮肿血压增高及发热等症状可能是急性肾炎，如血尿伴剧烈的尿频、尿急、尿痛者大多为急性膀胱炎。
通常情况下，儿童的血尿可能是肾炎引起的，但是不一定。
儿童的血尿是除了是肾炎引起的，还有其他很多的原因，比如尿道损伤、肾挫伤、膀胱损伤等外伤可以引起泌尿系统出血，使用对肾脏有损伤的药物可以引起血尿，还有哦先天性肾脏畸形、胡桃夹现象、IgA肾病、遗传性肾病、肾病综合征等，都可以导致血尿。；另外，血小板明显的减少，凝血功能障碍，也可以引起血尿。
