进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
精液一般是常规性检查是用肉眼观察精液的颜色、透明程度、黏稠程度和液化时间，用量检测量精液的量。精液由精子和精浆组成，其中精子占10%。其余为精浆。它除了含有水、果糖，蛋白质和脂肪外。还有多种酶类和无机盐。在检查之前，应该停止性交4天到7天。
临床进行精液常规检查，其判断的结果是主要是根据各项指标，通常精液颜色是灰白或乳白色，粘稠胶冻状，30分钟内自行液化，以及射精后1小时内有三级以上活动能力的精于应大于0.60。
卵巢早衰是指妇女出现闭经、血雌激素水平低下、促性腺激素浓度过高，有时伴有潮热、出汗等绝经症状，与生理性绝经十分相似而命名，也称之为早期绝经或早发更年期。卵巢早衰的妇女在40岁以前出现卵巢功能衰退现象者称卵巢早衰，卵巢早衰常伴有自身免疫性疾病。
肛瘘的检查方法可以做肛门指检，肛门指检为最常见、最直接的检查方法，可触及条索状物及硬结。还有就是美兰造影，将美兰从外口打进，如果美兰由肛门流出，可诊断肛瘘。影像学检查包括B超、磁共振、肛瘘造影。手术探查需在麻醉状态下进行。
