孕囊不规则的原因可能是受孕天数的计算有误导致孕囊偏小，还可能是由于月经推迟，排卵期后错，受孕时间晚，从而出现孕囊较实际停经天数小。而且胚胎本身发育和质量有关，与父母双方都有关系。
孕囊大小随孕周变化，是因人而异的。但是如果孕妇的孕囊不规则，就容易导致先兆流产。孕囊不规则很有可能是胚胎发育不好所致，如果出现孕囊不规则，很多孕妇在孕早期会出现孕囊不规则，最后宝宝还是会健康发育。
孕囊不规则是一种超声诊断，也就是孕囊发育不好，存在流产或先兆流产的表现，一般都会伴有腹痛、阴道内异常出血现象。导致孕囊发育不好的原因在怀孕早期时服用了影响胎儿正常发育的药物。妊娠早期某些病原微生物感染，如巨细胞病毒、人乳头状瘤病毒、梅毒螺旋体、流感病毒。妊娠早期接受放射线损伤。妊娠早期长期的情绪不好，心情过度压抑，经常哭闹。
孕囊形态不规则提示胚胎发育不良可能性大。卧床休息和注射黄体酮保胎治疗，一周后复查B超，若孕囊无明显增大、仍未见胚芽，可确诊稽留流产，继续保胎没有意义，须行清宫术。
一般情况下，如果是子宫腺肌症，可能会因为宫腔内部的条件不理想而造成妊娠的问题，从而造成妊娠后的先兆和自然流产。因此，在孕期最好是在妊娠早期就躺在病床上进行保护，此时胎儿尚未发育，胎儿着床也不是很稳固，而且还是腺肌病，很有可能会发生一些意想不到的事情。三个多月之后，孩子的状况已经很好了，不用再躺在病床上了。平时还要定期进行孕期的产前诊断和监测，有利于胚胎的发育和孕妇的健康。
