一般来说，停经40天b超看不到孕囊的主要原因是以下这些：
1、月经不正常、受孕晚，有的女人月经不规律，一般要40多天才来一次，这个时候，即使检测出来了，受孕的时间也比较晚，在子宫里见到孕囊的时间也比较晚。
2、可能是因为子宫外孕，也可能是因为妇科的炎症，比如输卵管炎。B超检查没有发现孕囊，有阴道出血、腹痛等症状患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。
一般是在怀孕六周42天的时候通过超声检查可以看出胚胎孕囊卵黄囊发育是否正常，但是有个别受精卵着床比较晚，也有可能会稍晚一些检查出来，可以再观察3到5天或者是一周左右再做超声检查。
要区别对待，如果平时月经不规律，有可能是停经时间长，但是妊娠的时间比较短。还有就是胚胎发育不良，建议一周后进行复查，如果在此期间出现了腹痛、阴道流血的情况，需要随时就诊。要注意多休息，避免情绪过于紧张。不要有太大的心理压力，平时要养成良好的生活习惯，要积极地锻炼身体，增强体质，注意休息，保证睡眠。
一般情况下，怀孕40天B超一般能看到圆形或者椭圆形的妊娠囊。
可以看到是在宫内还是在宫外，确定胚胎数目，排除异位妊娠，滋养细胞疾病，盆腔肿块等。女性在不同的时期，不同的停经时间，彩超下的表现不同。如果是平时月经周期为28天，怀孕40天，也就是停经40天，超声下必然是会见到直径在2-3cm之间的孕囊，并且应该可以见到卵黄囊的形态。
女性在怀孕后四十天B超会表现以下症状：
女性在月经规律的，在怀孕后一个半月左右去进行妇科B超检查，可以在宫腔内检查出孕囊或者是卵黄囊。但是若是月经不规律的女性，在妇科B超检查后，只能看见液性暗区或者是子宫内膜变厚，需要进行进一步的血HCG检查，再过一段时间再复查妇科B超检查情况，就可以在宫腔内发现孕囊和胎芽胎心的情况。
怀孕40天一般可以做B超。
首先要在怀孕初期进行B超检查，一般是在停经50多日后进行B超检查，如果月经周期不变的情况下，可以看到孕囊和胎心。孕期18-24周要进行一次立体B超，要对孩子进行详细的身体检查，主要是要注意身体的各脏器。32周后可以做一个B超，检查孩子的生长状况，检查孩子的双顶直径，股骨长，羊水指数，胎盘成熟度，胎位。
