一般情况下，患有手足口病高烧到39摄氏度，可以通过使用药物。日常护理等方式进行处理，具体内容如下：
有手足口病的宝宝高烧到39摄氏度时家长首先不要慌张，可以在医生的指导下给宝宝服用布洛芬或者对乙酰氨基酚，可以起到退热的作用，然后家长可以给宝宝多喂水，松开宝宝的衣服，还可以用湿毛巾擦拭宝宝的身体，以便身体散热。然后家长可以尽快带宝宝就医。有手足口病的患儿大多数是可以痊愈的，但是家长需要警惕重症病例，家长平时应做好宝宝个人的卫生护理，有利于身体健康。
宝宝发烧到39度可以洗澡的，用温水给宝宝擦拭身体，也是会有助于宝宝的降温的，一般需要注意环境的温度，如果温度适合这是可以洗澡。体温超过了38.5，必须要口服退热药物，检查有没有细菌感染，如果确诊有细菌感染，必须要对细菌抗菌治疗。宝宝发高烧的时候一定要多给宝宝喝水，宝宝的体温也是要控制在38.5度以下。
成人发烧39℃可以多饮水，通过多饮水来保证细胞足够的代谢，提高免疫力，饮水量在3500-4000ml。同时，可以通过物理降温来解决，躺在床上之后盖好被子，用温毛巾擦拭身体前心、后背、躯干、肢体，记住要用温水擦拭，且不能用凉水。
需要明确宝宝是病毒感染还是细菌感染，也需要医院化验血常规，结合自己的检查结果用药。发热可以物理降温与退热药交替退热，多喝温水，注意手脚保暖。所以及时就诊，注意多饮水。
尽早到正规医院儿科就诊，医生会根据病情做相关检查，根据检查结果，鉴别诊断，明确病因，给于合理的对症治疗，同时你要加强对孩子护理，多饮水，注意保暖避免着凉，保证房间空气清新避免空气污染。
需要积极抗感染治疗，同时要进行物理降温，可以外敷降温贴，也可以用抗炎药物控制体温，如果有明显的脓肿形成，还需考虑进行抽脓治疗，或者是切开引流手术，要注意多休息，多喝水。
