婴儿扁桃体发炎发烧应积极查明病因，针对病因进行治疗。
小儿扁桃体炎急性发作期，患儿会出现高热症状，如果患儿持续发烧五到七天以上，需及时到医院通过血常规检查、细菌培养检查以明确病因，对症治疗。
如果是病毒引起的，可采用抗病毒药物进行治疗，如果是细菌感染引起的，可采用抗菌药物进行治疗。其次给予退热处理，通常发热低于38度五时，医生会主张采取物理降温的方法，若是体温超过38度五时，可以服用退热药物。另外，扁桃体炎急性发作期，饮食宜清淡，可早晚用淡盐水漱口。
儿童容易发作扁桃体炎，因为这种时期扁桃体比较大，过了十岁以后扁桃体会逐渐的萎缩，要注意一孩子的口腔卫生，督促孩子早晚刷牙，饭后漱口，避免食物残渣存留在口腔当中，多吃青菜，多饮水，参加体育锻炼，冬季也要参加户外活动，提高身体对寒冷的适应能力，可以减少扁桃体发炎的机会。
打吊针对病毒感染导致发炎是没有效果的，还会有副作用，采用红光、微波、雾化等物理保守治疗。应吃些滋阴润肺作用的食物，有滋阴润肺作用的食物如：蔬菜、水果类，如萝卜、白菜、菠菜、冬瓜、苦瓜、梨、香蕉、苹果、菠萝、甘蔗、西瓜、橄榄等。肉禽类，如猪瘦肉、鸭肉、兔肉、猪肺等滋阴润燥，亦可常用。水产品如蛤蚌、牡蛎、鲍鱼、甲鱼、乌贼等多具滋阴清热作用，阴虚火旺者尤宜。
小孩出现扁桃体发炎，并且伴有发烧的症状，是需要及时使用抗生素药物治疗的。
扁桃体发炎程度相对较轻的患儿，一般可以口服青霉素类或者头孢菌素类的抗生素。如果患儿都扁桃体发炎程度较重，咽痛剧烈、发烧体温较高，需要进一步输液，进行抗感染治疗，同时适量的使用氢化泼尼松等激素类药物，可以帮助改善咽喉局部以及全身的症状。
患儿也需要注意多喝水，可以遵医嘱使用蒲地蓝消炎口服液进行治疗。
儿童的扁桃体发炎，一般考虑都是细菌感染的，单纯性扁桃体炎比较常见，孩子除了咽痛，吞咽疼痛和困难之外，会伴随有不同程度的发烧，而且很多都是高热，一般治疗主要就是对症的使用头孢类的消炎药物。
宝宝扁桃体发炎发烧可以抗生素和抗病毒药物同时服用。体温超过38.5摄氏度的话可以使用物理手段、退烧药或者使用药物降温使体温降低。如不减轻，可做青霉素皮试，皮试阴性可静滴青霉素。如果是宝宝扁桃体，发炎引起发烧，可以先使用物理方法来帮助宝宝降低体温。