通常来说，慢性肠炎肚子疼吃枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊、阿托品、山莨菪素等药。
慢性肠炎肚子疼可能是由于长期的炎症所致的肠神经受到了刺激导致的，可以口服枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊等调节肠道菌群的药物，还可以配合阿托品、山莨菪素等解痉镇痛类的药物。平时也要避免食用过多的生冷和辛辣的食品，避免对肠胃造成刺激，导致病情恶化。
一般情况下，可以通过临床症状、检查结果等来判断慢性肠炎，具体内容如下：
1.临床症状：如果患者患有慢性肠炎，可能会出现腹痛、腹泻、粘液脓血便等不适症状，病情比较严重时，患者还可能会出现发热、恶心、呕吐等表现。
2.检查结果：如果患者患有慢性肠炎，通过纤维结肠镜检、便常规检查、血常规检查等方式，通常能发现相关数值的变化，从而确诊患者的病情，并针对性地进行治疗。
小儿慢性肠炎老反复，家长要注意护理。
慢性肠炎最明显的特征就是病程较长，而且很容易复发。生活中要让孩子保持良好的心态，不要受到精神刺激，缓解心理上的压力。同时要注意衣服的保暖，多运动，加强身体。饮食上要注意多吃一些柔软、易消化、营养丰富、热量充足的食物，同时要注意多吃维生素、少吃生冷、油腻的食物。慢性肠炎患者不能吃有气的食物，因为这种疾病会反复出现溃疡和疤痕纤维，从而使结肠的弹性下降，吃豆制品、炒蚕豆、白薯等易引起肠道内气体充盈，从而出现急性肠膨胀、溃疡穿孔等并发症。
儿童慢性肠炎的症状主是反复腹痛，通常在进食后加重，疼痛部位不确切，多在脐周，有嗳气、早饱、恶心、上腹部不适、泛酸。部分可有食欲不振、乏力、消瘦及头晕，伴有胃糜烂者可出现黑便。
慢性肠炎是细菌，病毒，真菌或寄生虫引起的小肠和结肠的炎症。表现为腹痛，腹泻，稀水样便或粘液脓血便。小儿肠炎多因不洁东西所引起，故预防最要紧的是食物之清洁及保存安全。
能否获得治疗主要取决于引起肠炎的病因。细菌性肠炎通常发病于夏秋季节，进食不洁食物以后引起肠道菌群紊乱，通过及时的补液、以及抗生素治疗调整肠道菌群，通常可以获得治疗，而对于结核性的结肠炎，需要正规的抗结核治疗。