卵巢囊肿治疗后有复发的可能，而且术后复发对病人的后果不好，因此做完手术的病人应该注意定期到医院检查身体。检查包括内诊、B超等，对于良性多房性乳头状粘液性囊腺瘤，如果手术彻底一般不易复发，此病临床上20%—30%于双侧发生，但治疗卵巢囊肿并无特效药。
如果出现了身体卵巢囊肿，可能会妊娠的可能。卵巢囊肿的大小、性质及位置决定了其能否受孕。如果是一个很小的卵巢囊肿，可以受孕，而且不需要特别的治疗，对受精没有任何的影响。如果卵巢囊肿的发育速度太大，会导致卵巢的排卵和血液循环受到一定的限制。如果出现了卵巢囊肿的情况，可以去医院做详细的检查，确定原因，然后进行相应的处理。
如果这个囊肿非常大，一般直径超过七厘米才考虑手术切除囊肿。如果能够做囊肿剥出手术，一般不建议切除卵巢。如果说囊肿已经非常大，已经看不到了正常的卵巢组织，那么也可以将这一次卵巢全部切掉因为女性有软两个卵巢，切除一侧对女性的性功能并没有什么影响。
卵巢囊肿切除术后，应做病理切片进一步明确卵巢囊肿性质。术后应定期进行检查，因卵巢囊肿形成机理不明，卵巢排卵、卵巢组织增生则仍可再次形成卵巢囊肿。如较常见的卵巢巧克力囊肿，易复发，需通过使用口服避孕药、GnRH预防复发。
卵巢囊肿是不需要切除卵巢的。卵巢对于女性非常重要，如果完全切除一侧卵巢，虽然还有另一侧卵巢，但是如果是另一侧卵巢功能丧失或者出现囊肿，就给女性会带来很大的困惑，会出现更年期提前的症状。所以临床上对于卵巢囊肿的手术，只要单纯的将囊肿剥离下来，然后缝合剩余的卵巢组织就可以。