甲状腺双叶囊性结节大部分为良性结节，一般无需特殊治疗。如果有以下症状需要进行手术，也可以用射频消融治疗。
1、囊肿大，超过4厘米，严重压迫气管，有呼吸困难症状建议积极治疗。
2、结节突出体表，严重影响美观，令患者自卑。
3、患者有强烈的心理顾虑。
4、结节有实质性变化时。
5、伴甲状腺功能亢进者。
甲状腺多发结节的治疗方法主要包括两方面，保守治疗，如果甲状腺多发结节直径均小于一公分，且行甲状腺B超检查影像学分级属于三级以下，甲功检查没有异常，则可以行保守治疗，配合服用活血化瘀的中药进行对症治疗，如果结节有明显增长，则需要及时行手术治疗。
甲状腺囊性结节不严重。
甲状腺囊实结节通常为良性结节，但甲状腺囊实结节体积变化较大，多数囊实结节体积可达4-5cm左右。囊性结节已对人体有压迫症状，必要时可给予手术治疗。甲状腺囊性结节较小时，通常可定期随访。患者出现甲状腺囊性结节，建议了解甲状腺功能状态。如果甲状腺功能正常，通常不需要用药处理。确实，如果引起甲状腺功能减退症，需要药物替代治疗，总体甲状腺囊性结节并不严重。
甲状腺囊性结节是常见的甲状腺良性肿瘤，有一定恶变的可能，一般较严重。
甲状腺囊性结节单发较多，表面光滑，有完整包膜，腺瘤一般生长缓慢。但是有时会渗透到被膜中，压迫周围的血管、神经。囊内血管破裂，引起囊内出血，肿瘤短期内迅速增大，出现胀痛。由于可能引起甲状腺功能亢进和恶性病变，超声发现腺瘤建议切除手术。腺瘤小时可行甲状腺腺叶部分切除，切除后标本及时行冰冻切片病理检查，判断是否已有恶变。没有恶变就可以结束手术。检查如有恶性病变，应行甲状腺扩大手术及双侧甲状腺全切、周围淋巴结清扫。
如果良性结节比较小能够推动，活动度比较好，不用特殊处理。如果囊性结节个数比较多，体积比较大，活动度比较差，硬度比较硬，需要做B超检查，引导乳腺结节穿刺活检送病理，明确是否有乳腺癌的发生，必要的时候行双侧乳腺切除及周围淋巴结清扫术，防止病情进一步恶化。
甲状腺多发性结节的治疗需结合患者情况确定，若结节较小且进展不大，定期随访即可；若结节较大，影响到了患者呼吸和正常生活，则需进行外科手术干预；若结节影响到甲状腺功能，还应根据功能变化情况进行治疗。