龟头上有小水泡，主要是因为疱疹、包皮龟头炎等引起的。
1.疱疹：通常是由病毒感染所致，多见于神经系统，以水疱为主要症状，多见于皮肤黏膜，临床上可应用阿昔洛韦、伐昔洛韦、加巴喷丁等药物治疗。
2.包皮龟头炎：包皮龟头炎主要表现为阴茎包皮、阴茎头充血、红肿、糜烂、溃疡、小水泡等，严重时可出现尿道炎、尿道口狭窄、包茎等并发症，可以使用伊曲康唑、甲硝唑、氢化可的松等药物治疗。
龟头长小水泡，可能是由于患者出现了包皮龟头炎导致的，由于长时间的炎症刺激,可能会导致患者出现了,龟头有水泡的产生,对男性的健康是不利的。
龟头上长了小水泡的诱因较多,包皮包茎或者是长期手淫可能会导致患者出现的局部有水泡的产生,导致出现了水疱部位疼痛和水泡破裂的症状。此外，也可能是由于出现了疱疹病毒感染导致的,可能会导致出现群集小水疱,疱壁非常的薄,很容易会导致局部结痂,或者是出现了溃烂的现象。
男性平时多注意身体方面的护理,如果出现了龟头上长水泡的现象,根据患者的病因进行合理的治疗,建议到正规医院,通过使用检查的方法进行疾病的判断。
引起龟头上长水泡的原因可能是龟头炎和生殖器疱疹，两种病都有类似的症状。不过龟头炎容易治疗，治疗后平时对注意局部卫生，生殖器疱疹是一种性传播疾病，极难治好，容易复发。
可能与生殖器疱疹病毒感染有关，常见的有一些感染性的因素，如病毒性感染，霉菌性感染，细菌性感染等另外一些刺激性的因素。建议到医院行HSV检查，注意休息，清淡饮食，治疗期间避免性生活。如果是生殖器疱疹，应该是尽快抗病毒治疗的。
考虑两方面因素，第一方面考虑是龟头炎，是由于下体不洁，血液湿热，环境潮湿，皮肤不透气导致的因素。因为包皮过长会形成包皮垢，包皮垢刺激龟头，导致龟头发炎也会出现水泡的症状。另外一方面，也有可能是生殖器疱疹。于不洁性交有关。生殖器疱疹的病原体是单纯疱疹二型病毒。建议到医院进一步确诊，注意下体卫生，避免不洁性交。
龟头上长了水泡主要是生殖器疱疹导致的。
生殖器疱疹一般是由单纯疱疹病毒感染泌尿生殖器及肛门周围皮肤黏膜而引起，好发于包皮、龟头、冠状沟等部位，患者感染上单纯疱疹病毒后，龟头上常会出现水泡、烧灼感等情况。患者可以使用炉甘石洗剂、盐酸伐昔洛韦片等药物，应避免不洁性交，注意休息。