自闭症可能是由生理因素形成，如神经机能发展，生化机能发展，遗传因素或脑部受损所致。妇女怀孕期间可能因德国麻疹或风疹，使胎儿的脑部发育受损而导致自闭症。新陈代谢疾病亦会造成脑细胞功能失调，影响脑神经传递信息的功能，因而造成自闭症。还有，在怀孕期间窘迫性流产等因素而造成婴儿大脑发育不全，早产，难产，新生儿脑部受伤，以及在婴儿期患上脑炎，脑膜炎等疾病造成脑部伤害，都可能会增加罹患自闭症的机会。
一般情况下，小孩自闭症指的是小儿自闭症，其原因尚不清楚。可能与基因、神经系统等有关，具体分析如下：
1、基因：常染色体显著性基因也是导致其发生的原因之一。此外，一些自闭症儿童还出现了一些染色体不正常的情况，其主要特征是：染色体断裂。
2、神经系统：，一些儿童自闭症患者的大脑和大脑的生理和心理都发生了变化；
3、孩子妈妈怀孕时有可能受到某些疾病的影响。
目前，自闭症被认为是一种由各种生理原因造成的普遍的发展失调所造成的一种不正常的表现。
有自闭症可以心理治疗：心理辅导在自闭症的治疗中是极其重要的，要注意帮降低自卑和孤僻心理，增强本病的信心和愿望；严禁打骂患儿，避免责备埋怨，积极鼓励和谈心沟通是较有效的方法。药物治疗：西药虽然见效快，但副作用大，很容易使孩子导致营养不良而影响骨骼的发育，停药后可能导致复发，长期服，会使对药物产生依赖。而中药则见效慢，治疗周期长，并且药物口感不好会导致孩子难以配合治疗。
小孩自闭症的表现：语迟，说话少，不能说完整的句子，主要是仿说为主。听不懂指令，当爸爸妈妈叫孩子名字时，没有反应；无对视或对视差，和别人没有语言交流；不愿意和其他小朋友玩，对周围事物漠不关心；性格孤僻，不愿意与人之间交流；性格比较胆怯，害怕陌生的环境；无法正确表达想法，会模仿别人的动作；性格暴躁，不耐心时愿意发脾气，经常大喊大叫；走路会踮脚，不正视前方，跑来跑去。
儿童孤独症，一般在3岁以前就会表现出来，其主要表现症状是不同程度的人际交往障碍、兴趣狭窄和行为方式刻板等，其中约有四分之三的患儿伴有明显的精神发育迟滞，部分患儿在一般性智力落后的背景下具有某方面较好的能力。