首先，粪便中有很多细菌，肛周很容易受到感染，引发肛周汗腺、皮脂腺感染，而生疮疖、脓肿，温水坐浴能保持肛周的清洁。其次，坐浴20~30分钟，水温恒定在40℃左右，不仅能够促进血液循环，还能避免肛周炎症的侵袭。手术后，热水坐浴可达到缓解疼痛，加速伤口愈合功效。最后，孕妇活动量少，肠胃功能弱，大便干燥而引起痔疮。每次大便后用温水熏洗肛门，改善肛门局部血液循环，预防痔疮。
通常情况下，患有前列腺炎的人可以用热水泡着，这是一种很好的治疗前列腺炎的办法。可以多泡温泉，促进盆底血液循环，有助于前列腺的炎症。
其作用机制是通过温水的温热作用来缓解前列腺的炎症，但是随着人们的生活节奏越来越快，热水洗澡的难度也越来越大，因此在治疗上提倡规范、足疗程、少喝酒、少吃辛辣的食物，改善患者症状。
温水坐浴对缓解痔疮的症状和延缓痔疮的发展都有好处，经常温水坐浴可以有效改善肛门周围的血液循环。温水坐浴应该注意先熏后洗，可以将刚刚烧开的热水放入坐浴盆中，然后利用热水挥发的蒸汽熏蒸肛门约15分钟，待水温下降至40摄氏度左右，再将屁股完全坐进盆中，肛门完全没入水中清洗15分钟。
温盐水坐浴效果更好，遵医嘱在肛门内置药丸，大便干燥时加服通便药物，多吃水果和蔬菜，以防便秘，避免蹲厕过久，每日做提肛动作。近期不要吃酸辣及刺激性食物、多喝水及少吃油炸类食物。
肛裂使用温水坐浴有可能获得自愈，在裂伤比较表浅时，通过温水坐浴，同时养成良好的排便习惯和生活习惯，保持大便松软，浅表的裂伤可以治愈，而无需手术治疗，所以说在浅表的肛裂时使用温水坐浴，有可能自愈。
物理治疗最常用的方法就是温水坐浴，温水坐浴是对前列腺炎的症状，可以有很好的疗效。温水坐浴主要是通过对前列腺进行温度热疗，有助于改善局部前列腺的血液循环，从而减轻前列腺充血，使前列腺炎、尿频、尿急、尿痛等症状得到缓解，长期规律的温水坐浴可以有效的预防前列腺炎的复发。