一般情况下，男性尿道口有肉芽可能是尖锐湿疣导致的。具体情况分析如下：
如果男性近期发生了不洁的性接触，可能会感染人乳头病毒，进而引起的尖锐湿疣，出现菜花状赘生物。一般来说，这种情况还是应该前往正规医院的泌尿外科做激光或者电灼去除这样的新生物，然后再用干扰素凝胶涂抹治疗。治疗期间必须要避免不洁的性接触，然后避免辛辣刺激的饮食，绝对不喝酒，定期的复查才能够有效地预防这样的东西复发。
通常情况下，男性尿道口长肉芽可以通过激光、冷冻、电灼进行治疗。
如果不干净的性生活导致的人乳头瘤状病毒感染，可能会使导致尿道口出现肉芽。患者可以通过血液检测病毒抗体来确诊。如果是尖锐湿疣，建议尽快到医院的泌尿外科进行激光、冷冻、电灼等手术，以消除尖锐湿疣。再用干扰素针剂进行一个月的治疗，可以完全清除残余的病毒，防止以后复发。
男性尿道口刺痛可以通过药物治疗、生活护理等方式进行改善。
尿道口刺疼一般是由于尿道发炎引起的，当尿道发炎的时候会导致尿道口有一股分泌物。如有上述症状，应做尿道分泌物涂片、支原体等相关的检查，以确定有无细菌的感染。尿路感染是一种传染的疾病，可以通过性接触进行传播，因此如果有可能患上了某种性病，一定要及早诊断，避免出现延误和不及时的症状，导致病情恶化，甚至在同房的时候还会传染给对方，给自己带来不必要的困扰。严重时，需要在医生的指导下使用药物治疗。
尖锐湿疣好发于生殖器和肛周，男性多见于包皮、系带、冠状沟、尿道口、阴茎体等部位，男性包皮过长是尖锐湿疣发生的促进因素，损害初期为细小淡红色丘疹，会逐渐增大增多，表面凹凸不平呈乳头样、鸡冠状或菜花样突起，红色或污灰色。
皮损裂缝间常有脓性分泌物的淤积，有恶臭，且可因搔抓而引起继发感染。如果感染尖锐湿疣，建议及时到医院进行诊治，治疗诱因，消除炎症。
男人的尿道口流脓是否能够自行愈合取决于自身的具体状况。
如果是男性的尿道口流脓的症状并不是很严重，一般是因为自身的免疫力比较强，经过一段时间的调养就可以自己痊愈了。但是，如果出现尿道口流脓的症状，患者自身免疫力低下，很有可能是不能自行痊愈的，可以通过口服的方式来进行治疗。如果是淋菌性尿道炎，可以口服头孢曲松、青霉素等。日常生活中要注意个人的卫生，保持尿路的干净。
一般情况下，男性尿道口流脓多为尿道炎，特别是淋球菌性尿道炎。
尿道炎主要表现为尿道分泌物增多，尿道口流脓性分泌物，同时伴有尿频、尿道疼痛，特别是排尿时尿道内及尿道口烧灼或刺痛等情况。
如果有不洁性交史，特别是性活跃期的中青年男性，不洁性交后7天左右出现尿道口流脓等症状，应去医院做尿道分泌物涂片检查。