隐球菌性脑膜炎要治愈，属较难，可出现不同程度后遗症，建议病人能及时就医处理，以免病情恶化。
对于早期阶段的隐球菌性脑病患者，可以使用抗生素来进行预防和治疗，但是如果在后期出现了感染症状，则需要采取手术或者其方法进行治疗，以防止进一步发展成为严重并发症而导致死亡。隐球菌性脑膜炎治疗原则是早期发现，早期处理，但是，由于新型隐球菌属于真菌，仅有少数抗真菌药物对其有治疗效果，因此，治疗时间将相对延长，还容易重复。
隐球菌性脑膜炎是一种以新的隐球菌感染脑膜和脑实质而引起的中枢神经系统的一种亚急性或慢性疾病。因该病病情进展严重，预后差，病死率高。但若及早发现并积极使用抗菌药物，则有生还的希望。
如果不及时治疗，患者往往几个月后就会死去，而接受治疗的病人，往往也会留下一些神经系统的并发症和后遗症。因此出现此病的患者，要积极进行治疗。
隐球菌脑膜炎，多数病人早期可以出现发热，一般病人的体温在37度5至38度之间，严重时可以出现头痛，恶心，呕吐，有些病人可以表现为视物模糊，也可能会出现意识障碍。病人可出现脑膜刺激征。病人可以出现眼球活动异常，也可以出现面瘫，听力障碍。有些病人可能会出现癫痫发作，也可出现精神症状，一部分病人可以出现偏瘫，共济障碍等。
一般来说，隐球菌脑膜炎也是可以感染的，传染途径较多，如颅脑损伤患者，细菌可从开放型颅脑损伤伤口进入颅内，发生颅内脑膜炎。此外，鼻窦、中耳炎或乳突炎可能由相邻病灶感染颅内，也可能感染群血症、败血症、身体他部位化脓性病灶。但接触这类菌并不会感染隐球菌性脑膜炎。正常人经常暴露于新生隐球菌环境中，但极少发病。病菌只有在机体抵抗力下降时，才容易侵入人体致病。
给抗真菌性药物治疗，颅内压较高的，还可以给脱水剂降低颅内压，平时保持心情愉快，不要激动，要多吃新鲜的水果蔬菜，保持营养均衡，不要做剧烈的运动，要多卧床休息。减少行走次数。
隐球菌脑膜炎的机率为56.6%～81%，但停药后有1/3病例可能复发，需要进行维持治疗。对于出现的颅内高压症状，必须及时处理，否则可能发生脑疝引起死亡。对于意识清楚的应鼓励进食高蛋白高营养食物，增强抵抗力，同时可输入新鲜人血浆或全血，补充各种维生素。