肛周囊肿的症状还是比较明显的，首先局部会出现红肿并伴有发热现象，常为低热，有的时候可出现高热，病者还会有整个身躯倦怠不适，食欲不振，睡眠欠佳等。疼痛是常见的肛周脓肿的早期症状，为逐渐加重的持续不间断性肿痛或跳痛。多数需通过手术治疗。
直肠肛管周围脓肿常有的症状是：先感到肛门周围出现了一个小硬块或肿块，继而疼痛加剧、红肿发热、坠胀不适、坐卧不宁、夜不能眠、大便秘结、排尿不畅成里急后重等直肠刺激症状。并随之出现全身不适、精神疲惫乏力、体温升高、食欲减退、寒战高热等全身中毒症状。
宝宝肛周脓肿早期会出现肛门部局限性的红肿热痛，早期一般不会破溃流脓，还可以伴随有全身的症状：没有食欲、经常因为疼痛不适而哭闹、发热、大便干小便黄等。宝宝发病初期表现为肛门部胀痛，出现化脓时有跳痛的症状，特别是在排便时宝宝的疼痛会明显加重。
肛周脓肿是在肛周化脓，出现炎性包块，局部软组织化脓以后会引起病人非常明显的症状，就是非常的疼痛。肛周脓肿主要的发作部位是在肛门周围的间隙，所以病人能摸到局部非常明显的包块，红肿热痛非常明显，经常伴随发烧的情况，低烧在38度左右，高烧病人可以到40度，而且会出现排便不畅，影响排便甚至影响小便，出现小便不畅，所以肛周脓肿一旦发现，一定要及时就诊，而且要及时手术。
肛周囊肿开始时先感到肛门部出现一个小硬块，坠胀疼痛，肛门部难受，继则出现红肿，局部皮肤发烫，疼痛加重，全身可出现倦怠不适、食欲不振、坐卧不安、夜寐不宁的体温升高等症状。深部脓肿还会引起会阴部和尾骶部胀痛，出现恶寒发热全身中毒症状。