矮小症可以酌情给予营养、运动和心理治疗、病因治疗、激素替代治疗。矮小症是指儿童的身高低于同性别、同年龄、同种族儿童平均身高的2个标准差（-2SD，标准线称SD），每年生长速度低于5厘米者。
矮小症的治疗方面首先判断病因，包括内分泌的因素、非内分泌的因素。内分泌的因素常见的包括生长激素的缺乏，与垂体有关，也与颅内的一些病变有关。如果颅内有一些器质性的病变，可以针对器质性病变进行治疗，之后如果需要进行生长激素的替代治疗，就给予生长激素的替代。
若子女周岁时身高小于同龄同性2个标准差，或者小于p3，则确诊为矮小症，需进一步查明其成因。矮小症是一种遗传性疾病。矮小症是由于生长激素缺乏所致，甲状腺功能低下等，先天性软骨发育不良的特纳综合征，青春期发育推迟，家族性矮小和特发性矮小，没有明确病因。
如果出现孩子存在矮小症，则应该及时就诊治疗，必要时可以通过注射生长激素的方式进行处理。
孩子矮小症经过积极治疗是有长高的希望的。
担心孩子有矮小症要先了解正规治疗以及就诊的流程，避免错过最佳的治疗时机，造成无法弥补的后果。建议选择三级甲等医院进行治疗，到单独的小儿内分泌科就诊，进行系统的内分泌检查。矮小儿就诊要到小儿内分泌科，避免影响孩子治疗效果，对于矮小症的孩子，及时规范地治疗后是可能会长高的。
矮小症最佳治疗时间是3~12岁。
矮小症是小儿内分泌科的一种常见病症，一般小于同龄人两个标准差就是矮小症。矮小症应该尽早进行治疗，如果是女性来例假后，男孩的嗓音发生了变化，说明孩子已经到了青春期，这时候进行干预可能会起到很大的作用。最关键的是，在早期介入的过程中还有很大的余地，而且有的孩子的体重也比较轻，治疗起来也会比较方便，所以在发现孩子个子矮小的情况下，要及时的进行治疗，这样才能达到最好的效果。如果在孩子的骨骺完全闭合之后，才进行干预，可能会没有效果，进而给孩子带来不良影响。