男性性功能障碍包括勃起问题、射精等，需要选用不同检查方法进行检查。
例如，以某种量表的形式请患者填写，对其某些心理问题或者对其性生活某些情况有了初步认识，除其他外，也有经过实验室考察，实验室要经过几次血液检查，例如性激素，甲状腺功能，血脂等、血糖和其他这些都会影响勃起功能。当然也可以检测前列腺液和精液中精子数等。另外就是进行了前列腺液化验后再去看，一般都能查出阳性结果。
也有一些是通过对阴茎血流动力学进行检查，例如向阴茎内注入一些血管扩张剂药物以进行b超检查，对阴性血管血流状况进行调查。
性功能障碍，比如勃起功能障碍、阳痿，常见的检查就是抽血查性激素和阴茎血流检查，或者阴茎海绵体的彩超检查、阴茎动脉造影检查。如果是早泄，B超检查前列腺精囊，或者按摩前列腺液检查；有些可能也查一下内分泌激素，比如甲状腺激素测定。
关于性功能障碍问题，要先去泌尿外科或男科检查，患者要把病史、性生活年限、有无失败性交史，严重心理负担等情况报告医生，还要说明过去有无高血压、心脏病、糖尿病、内分泌疾病，有无神经系统等病变。有没有服用一些药物引起无法勃起，如利尿剂，降压药，心脏病药，安定及抗胆碱药和抗抑郁药等，有没有外伤手术史，有没有长时间熬夜和酗酒。
通过这些病史，医生将进行有关检查，如国际勃起功能评审表等，以评价勃起功能障碍程度，并可进行夜间阴茎勃起试验，还可进行阴茎海绵体内注入血管活性药物、阴茎血管造影检查及勃起神经等检查。
根据这些检查可判断是心理性勃起功能障碍还是器质性勃起功能障碍以及有无动静脉窦，经过这些检查才能制定出相应治疗方案。
性功能障碍需做龟头神经敏感度检查、抽血化验激素水平、阴茎血流多普勒检查等检查，具体分析如下：
如果体内雄激素水平不够，可以服用十一酸睾酮胶囊或者金匮肾气丸、五子衍宗丸等补肾益气的药物。阴茎海绵体充血功能不全，可以服用枸橼酸西地那非片、红景天胶囊等。如果是因为龟头过于敏感，可以用利多卡因或达克罗宁软膏来缓解龟头的敏感度，通需要进行头神经敏感度检查、抽血化验激素水平、阴茎血流多普勒检查等检查后再选择药物治疗。
男性勃起功能障碍的检查项目分为有创、无创两类，无创检查包括性激素全套、NPT，也称夜间勃起功能检测，通过NPT机器可检测勃起状态。正确认识男性勃起功能障碍，偶尔勃起不良，不代表性功能、勃起功能异常。
生化检查，血、尿常规、肝功能、肾功能、血糖、血脂等常规检查，根据特殊情况，可以做性激素检查、精液常规、宫颈液常规检查。影像学检查，要是针对生殖器官的超声、CT或者是MR检查。特殊检查，根据病因进行针对性检查。