原则上小于四厘米的肾囊肿是不需要治疗的，大于十厘米以上的肾囊肿可以考虑做开窗去顶手术，但这个手术是可以择期来做的。结石如果大于0.6厘米以上，需要考虑做体外冲击波碎石或者手术治疗，小于0.6厘米的话，可以尝试药物排石治疗但如果目前并没有出现明显症状的话，那么肾结石以及肾囊肿当前是不需要治疗的。
我认为主要取决于肾功能是否有所改变。如果囊肿的肾功能也发生了变化，要在彩色多普勒超声的定位下穿刺取囊肿。对于肾结石问题，它主要取决于结石的大小。如果小于电6公分，仍有可能将其排出。相反，我认为体外碎石术是普遍需要的。
不属于是肾结石的，但是有囊壁钙化现象就要注意了，因为有了钙化灶之后会演变成结石的，一般不需特殊处理，肾囊肿伴囊壁钙化灶可能是囊肿壁有钙质沉积造成，不需特殊治疗了，平时一定要多喝水。
肾结石肾囊肿囊内有钙化是肾钙化灶，钙沉积在骨骼以外称钙化灶，是疾病愈合的表现，不排除是肾结核，结石等导致的，进一步检查确诊，主要是由于肾以前发生过慢性炎症，炎症机化，钙化，这是一系列变化，如果钙化灶不大，没什么问题的，无需特殊处理，如果有肾结石按照肾结石的治疗原则进行治疗。
肾囊肿和肾结石是两个不同的疾病，要看肾囊肿的大小，如果是特别小的肾囊肿，不会特别影响肾功能，如果是特别大的肾囊肿，会对肾组织造成明显的破坏，出现肾功能的下降，会影响性功能，肾结石的严重程度，要看肾结石的大小以及所处的位置。
肾结石加肾囊肿可能严重，也可能不严重。
一般来说，肾结石可以是很重的，也可以是轻的，比如肾囊肿，如果体积很大，并不会太严重。囊肿有可能是因为囊肿有炎症，或是有很大的。一些肾脏脓疡伴有炎症，会有高烧，高达39~40℃，重则会导致感染，危及性命。肾结石由于长期的反复炎症刺激，还有一些肾结石会发展成肾癌，通常是鳞癌，但手术和其它的疗法对疗效都很低，而且愈合非常不好，因此肾结石合并肾囊肿并不是很严重。这种疾病要看患者的具体病情，如果出现了肾结石或者肾囊肿，一定要到正规的医院泌尿外科进行检查。
