B超发现卵巢囊肿，明确告知囊肿是良性还是恶性，是否诊断卵巢巧克力囊肿，这是不现实的。b超可判定盆腔是否有囊肿，囊肿位置及囊肿内部结构，但不能诊断子宫内膜异位症。子宫内膜异位症有时很难与卵巢恶性肿瘤、结核病和炎性肿块区分开来。
病理检查是确诊肿瘤的金标准，一般是不会误诊的，如果病理检查明确是巧克力囊肿，那么就是确诊是巧克力囊肿了。如果不放心，也可以携带病理切片去上级医院进行会诊。如果确诊是巧克力囊肿，建议用药防止复发。
B超发现卵巢囊肿，一定要医生当时明确告知囊肿是良性还是恶性，是否诊断卵巢巧克力囊肿，这是不现实的，b超可判定盆腔是否有囊肿，囊肿位置及囊肿内部结构，但不能诊断子宫内膜异位症。因为子宫内膜异位症有时很难与卵巢恶性肿瘤、结核病和炎性肿块区分开来。
可以进行超声检查及腹腔镜检查，另外还可以结合妇科检查辅助判断，不过腹腔镜检查是目前临床上诊断卵巢巧克力囊肿效果最好的方法，引起不孕不育的原因较多的，需要先注意去医院做下检查查找原因，然后再对因治疗，注意卫生等。
月经干净后，或者月经期间都可以的，主要的检查项目包括内分泌检查、B超检查等内容。巧克力囊肿如果增长速度比较快，是需要考虑手术治疗的。当囊肿伴有出血、感染和恶性转化时，表现出异质性，CT值增加。
巢巧克力囊肿是临床上非常常见的一种卵巢疾病，严重的会影响到病患的日常生活以及工作，给女性病患带来很大的危害。针对卵巢巧克力囊肿如何检查这个问题，需要做的检查有：阴道后穹隆穿刺。超声检查，进一步检查明确病因后遵医嘱对症治疗。