慢性直肠炎可以通过积极治疗。对于慢性直肠炎，腹痛、腹泻和腹胀是主要表现。可出现便秘和腹泻交替出现，粘液伴有充血和肛门剧烈疼痛。通常需要清洗、抗炎药物治疗以及禁止辛辣和刺激性食物。
慢性直肠炎要治疗两个月-三个月，忌辛辣刺激高脂油腻饮食，虽然不吃寒凉的油腻难消化的食物就不会肚子疼，但是还是应该调理一下，让自己即使服用寒凉和难消化的食物也不会肚子疼。
慢性直肠炎可以用中医治好的。但是这是慢性疾病，治疗比较缓慢，只能慢慢缓解。这种疾病饮食上要注意，不要吃辛辣、油炸的食物，以粗纤维食物为主，这样对病情的恢复，还是有帮助的。可以口服相关药物进行治疗。
慢性直肠炎是一种原因并不很清楚，反复发作的慢性疾病。从现在有的临床的研究来看，并没有一种治疗可以导致它治好不再发作。但是慢性直肠炎是可以临床控制症状的，通过药物治疗包括灌肠、口服药物以后能达到临床没有任何症状。通过饮食以及生活调理，还有避免诱因的出现来长期的让它不发作，这样对于慢性直肠炎也就叫临床控制了。
慢性直肠炎是可以做手术的，慢性直肠炎是由细菌病毒引起的。建议服用一些抗生素来缓解。平时要注意保持心情愉快，避免过度的情绪紧张。同时，要注意保持腹部温暖，避免受凉。
慢性直肠炎治疗没有明确规范，可以选择中医治疗，口服一些健脾补肾、益气除湿的中药。也可以选择中药灌肠，效果明显，西医治疗主要是抗感染促进胃肠蠕动，必要的营养支持，慢性直肠炎的病人一定要养成良好的饮食习惯，注意饮食卫生，注意休息，清淡饮食，保持良好情绪。