脑炎深度昏迷醒过来的时间是不能确定的，如病毒性脑炎，在发病一个月以后，可以逐渐的恢复，如果脑炎属于自免性或结核性，昏迷的时间可能较长，还有一种类型的脑炎，如真菌感染引起来的，昏迷的时间也会比较长。
许多病毒性脑炎可恢复。存活与康复的机会很大程度上取决于病毒的类型。如细菌性脑膜炎得到及时治疗，死亡率不到10％。宝宝可能醒过来，不会有后遗症的可能性不大，比如智力障碍、活动差。
儿童出现脑炎昏迷时比较严重的。病毒性脑炎的临床特征是突然高热、意识障碍，头痛、颈强、上肢与颈部及肩胛肌瘫痪。普通型病儿早期采用适应药物能够彻底治疗，并发症和后遗症很少见。如有经济实力，可将孩子转院到当地更好的三甲医院进行治疗。脑炎患儿的治疗和康复都是一个非常漫长的过程，需要家人的耐心和付出。
病毒性脑炎的病程相对于其他种类的脑炎要短一些，昏迷的时间因人而异3天到1周不等，有的甚至有2周多，经过积极抗病毒治疗和对症治疗预后还是可以的，至于预防就是提高免疫力防止感冒拉肚子、受凉等，使身体免疫力降低的情况可以适当服用一些药物提高免疫力，需要积极采取治疗措施，如抗病毒治疗、大剂量激素冲剂疗法、控制癫痫发作，使用一些脑细胞营养药进行治疗。还是有可能恢复清醒的。
脑炎患者一旦出现昏迷现象，需根据炎症出现的位置和轻重，来判断病人什么时候醒了，有的病人甚至连续昏迷不能醒来。
若是出现意识障碍时，则可能是因为颅内感染而导致脑部坏死或其他原因引起脑组织水肿等情况。若处理条件良好，大部分病人昏迷7-20天以后就会渐渐苏醒。所以患者应及早发现，及早处理，减少炎症给自己带来伤害。对于急性重症脑炎而言，病情进展快，持续时间长，容易出现并发症。昏迷病人是否清醒，关键是看炎症是否得到控制，神经功能是否处于康复状态，例如，病毒性脑炎在临床中最为多见，病后西医以激素治疗、蛋白和其他方法处理，可对受损脑神经进行调控，当脑神经功能得到恢复时，病人可渐渐醒来。
如处理方法不恰当，拖延了处理时间，受累神经可因缺血时间太长出现坏死，此时病人很可能醒不过来。对于此类疾病应尽早明确诊断并给予相应治疗措施。
严重脑炎昏迷能治好。应用专业的脑内科来检查脑积液，然后做细菌培养加药敏试验，这样才能选择敏感的抗菌药物，一般在两周左右是可以恢复的，同时要选择相应的营养对症支持。