治疗方法非常多，包括手术治疗，免疫治疗，化学治疗，中医治疗，放射治疗等。非浸润性低级别乳头状尿路上皮癌常用的治疗方式是手术治疗，放化疗治疗及中医治疗，手术治疗是将非浸润性低级别乳头状尿路上皮癌的肿瘤病灶进行切除，如果病灶切除不彻底则需要通过放化疗进行彻底清除。
高级别乳头状尿路上皮癌有以下治疗方法：
首先是做膀胱根治性的切除或者是肾脏输尿管的根治性切除。病情在手术后还需要配合化疗来预防肿瘤复发，化疗期间应该用一些胸腺肽针增强免疫力，在治疗上有很好的效果。
建议在饮食上注意低脂低盐，不能吃过于油腻的食物，以及辛辣刺激的食物，同时高热量和高脂肪的食物也要少吃。
低度恶性潜能乳头状尿路上皮肿瘤，可通过尿道肿瘤电切手术来治疗。低度恶性潜能的乳头状尿路上皮肿瘤是一种恶性肿瘤，只不过这种类型的肿瘤恶性程度非常低，转移和复发的可能性也比较低。
高级别浸润性尿路上皮癌就是膀胱癌的一种。泌尿系统中的肾盂、输尿管、膀胱黏膜和尿道黏膜，称为移行上皮，尿路上皮发生的恶性肿瘤称为尿路上皮癌，肿瘤越高级，恶性程度越高，越难控制，越容易侵犯周围组织。
在临床上看这种低级别的尿路上皮癌是可以得到治愈的，膀胱肿瘤一般是膀胱发生的肿瘤，它的症状一般是无痛、间歇性的肉眼血尿。膀胱癌进展是比较慢的，出现了血尿一定要做一个尿常规和泌尿系统的超声检查。
高级别浸润性尿路上皮癌属于膀胱癌的一种，一般是在做膀胱镜电切术后病理的结果。如果局部有浸润比较明显，还有脉管内癌栓，后续还需要进一步做膀胱部分切除或者是膀胱全切。如果病灶比较局限，虽然局部有浸润，但是电切比较彻底也可以。术后需要配合吉西他滨等为主的全身化疗巩固电切的疗效，同时化疗也可以针对可能的转移灶起作用。除了化疗之外，还可以考虑做放疗，电切术后还需要做膀胱灌注化疗控制病情发展。