先兆流产有阴道出血，先少后多，小腹部阵发性坠痛，宫外孕一般阴道流血量很少，宫外孕破裂为下腹部撕裂样疼痛，大出血可导致休克危及生命，在宫外孕早期一般临床症状不明显。
在怀孕早期宫外孕出血的情况并不明显，而流产引起的出血可能在怀孕5周左右就会出现。宫外孕是一种异位妊娠，会在怀孕6周左右出现异常的阴道出血现象，需要通过hcg的抽血检查以及超声波的检查，来进一步确定怀孕的情况。
先兆流产和宫外孕出血hcg看不出什么区别，判断这两个疾病需要做进一步检查。可以通过监测孕酮和hcg，如果是先兆流产，hcg就会隔天翻倍的增加，子宫B超可以看见孕囊；如果是宫外孕，hcg的值就上升缓慢。
先兆流产阴道出血量少无胚胎组织，无腹痛或轻度疼痛，子宫大小与孕期相符合；而宫外孕腹痛为突然撕裂样疼痛，阴道流血不规则，量少，可见蜕膜管型，出血多可见休克症状，腹部压痛明显可触及子宫旁包块，阴道后穹窿科穿刺出不凝集血液。
先兆流产可以进行保胎治疗。宫外孕是手术治疗。先兆流产是宫内妊娠，超声在子宫内可以见到孕囊。宫外孕是受精卵着床在子宫外，常在输卵管，因此超声宫内没有妊娠囊，有时可以见到孕囊位于输卵管。
一般生化妊娠是受精卵着床不成功导致的阴道出血，宫外孕流产是宫腔内没有孕囊的情况下有阴道出血。一般生化妊娠和宫外孕自然流产一般是不容易区分的。可能是宫外孕流产出血，一般不容易区分。