对于皮下囊肿，需要进行外科治疗，如果是皮下囊肿比较小，可以先进行保守治疗，不需要进行治疗。
皮下囊肿一般有皮脂腺囊肿和皮样囊肿两种类型，一旦发生感染，需要手术治疗。另外，由于炎症引起的肿物与周围的界限不清楚，应积极进行抗感染治疗，待感染得到控制后，再进行外科切除。有些皮下囊肿与局部皮肤有很大的联系，要将其连同局部皮肤一起切除，以免再次复发，因此治疗皮下囊肿的方式主要是手术。保守治疗只能暂时观察，一旦病情发展到一定程度，就要进行外科手术，以免肿物生长太大，导致局部皮肤缺损较大，需要进行植皮。
皮下囊肿可能会癌变，但概率极小。
如果皮下囊肿患者有囊性畸形，那么恶性的可能性较大，一般都是良性的。皮下囊肿切除后需要做好组织切片检查，主要是皮脂腺囊肿，皮样囊肿，皮样囊肿等。通常情况下，头部、面部、筋、躯干等都需要外科手术，如果不是感染或者囊肿，可以完全切除。局部皮肤要不要切掉，要看与周边的肌肤情况。当然，部分缺损的皮肤是可以避免再次出现的，这要看其体积，如果是比较大的，可以尽可能的保存周边的肌肤。
可选择手术治疗，如果术前有红肿热痛等炎症表现，则应首先控制炎症，后期再手术，术后服用消炎药治疗1周即可，7-10天可痊愈。检查伤口敷料，发现有感染迹象时进行局部处理。
如果不治疗是没什么特别大的影响，但是如果囊肿发生了一些变化，而且伴随痛痒的感觉，要早点到医院进行检查治疗，以免产生一些不良的后果，平时不要用手去挤压，以免造成感染加重病情，饮食上要以清淡为主，不要吃一些刺激性和辛辣食物。
皮下囊肿如果比较少且不严重，通常情况下是可以不用管它的。
如果皮下囊肿较多较大，建议患者及时到正规的医院进行检查治疗，避免耽误病情，导致发生感染。
患者平时要注意个人卫生，经常用温水洗脸，保持脸部的皮肤清洁干燥，多喝水，多吃清淡易消化的食物，避免吃脂肪量高油炸的食物。注意休息，保持良好生活作息，避免熬夜，适当的参加户外的活动，增强自身免疫力。
皮下囊肿可以不手术的保守治疗也可以。皮下囊肿分为腱鞘囊肿、皮脂腺囊肿、表皮样囊肿等，治疗方法不一样。腱鞘囊肿发生在四肢的腱鞘上，质地比较硬，开始包块比较小，约绿豆黄豆样大小，后来可以慢慢的增大。
