扁桃体炎可经常出现咽痛，并易反复出现感冒及急性扁桃体炎发作史。平时可有咽干，咽痒，咽异物感，刺激性咳嗽等症状，有的还可出现口臭。如果扁桃体肥大，还可出现打鼾症状。
扁桃体炎处于不同时期时，引起的主要症状不相同。急性扁桃体炎以局部症状和全身症状为主，局部以剧烈激烈的咽喉部疼痛为主，并且在吞咽时加重，可以放射至耳部，下颌淋巴结常常伴随有明显的肿大。由于这种急性感染起病较急，可伴随有畏寒、高热、头痛、食欲下降、乏力、全身不适等，儿童可以因为高热而引起抽搐、呕吐、惊厥等。
小儿扁桃体炎跟营养不良、佝偻病、消化不良、缺乏锻炼、过敏体质有关，小孩免疫力低容易患扁桃体炎。有原发性的免疫缺陷或后天免疫功能低下，抵御病原微生物的能力低就容易患急性扁桃体炎。
小儿患扁桃体炎全身感染症状明显，发烧可能高39度-40度，伴有寒战、恶心、呕吐、全身乏力、头痛及全身痛、食欲不振的症状。有的因高烧导致惊厥，检查咽部扁桃体有脓。小儿扁桃体发炎可能说自己嗓子疼、咽东西疼、咽水疼。小儿张嘴压住舌头能看到咽部有两个红肿的扁桃体，有的可能有脓，肿大得厉害会导致呼吸困难甚至危及生命。
扁桃体炎的症状有剧烈咽痛，伴有吞咽困难。畏寒、高热、头痛等全身症状。
扁桃体炎分为急性扁桃体炎和慢性扁桃体炎，慢性扁桃体炎的时候主要就是扁桃体充血肥大，如果随大到一定程度，影响到患者晚上休息，引起严重的打呼噜的症状，后期可以选择手术的方式解决，一般来说，急性扁桃体炎主要就是对症的使用抗生素治疗，急性扁桃体炎大多都是因为细菌或者是厌氧菌混合感染的原因造成的，双侧扁桃体充血肥大，表面会有脓性分泌物，患者会伴随不同程度的咽痛，甚至伴随有高热的情况。
慢性扁桃体炎的早期症状主要为咽痛。慢性扁桃体炎以反复发作的咽痛为主要表现，可有咽内发干、发痒、异物感、刺激性咳嗽等轻微症状，有时还可出现口臭。如果扁桃体肿大，过度肥大的扁桃体可能会导致吞咽困难、说话含糊不清、呼吸不畅或睡眠时打鼾。
慢性扁桃体炎多是由于急性扁桃体反复发作，或者由于扁桃体窝内引流不长，窝内细菌病毒滋生感染而演变为慢性炎症，主要表现有咽痛，容易感冒以及急性扁桃体炎反复发作，平常自觉症状比较少，可有咽干、发痒、异物感、刺激性咳嗽等症状。如果扁桃体隐窝的分泌物有大量厌氧菌感染，可以出现口臭。