约90%的肛瘘病人属于腺源性肛瘘，这种肛瘘是由于肛隐窝感染引起。除了腺源性肛瘘外，还可能有一些特异性原因的肛瘘。比如结核病会引起肛周的结核性感染，导致结核性肛瘘的发生；炎症性肠病也可发生肛周的并发症，表现为肛瘘，肛裂等。一些外在性的因素，比如痔疮肛裂手术处理不当，引发肛周感染，导致肛瘘；跌伤，刀伤，枪伤，如果恰好在肛门直肠部位可能因继发感染引起肛瘘。
高位肛瘘是指瘘管位于外括约肌深部以上，可分为高位单纯性肛瘘（只有一个瘘管）和高位复杂性肛瘘（有多个瘘口和瘘臂）。脓液多少与瘘管大小、长短及数目有关。新形成或炎症急性发作期的瘘管脓多、味臭、色黄而浓厚，分泌物刺激皮肤而瘙痒不适，经久不愈的瘘管脓液较少或时有时无。当外口阻塞或假性愈合，脓液急剧增多，局部脓肿，体温增高。常因肛瘘炎症急性发作或有支管形成。
高位肛瘘是否挂线，可选择挂线疗法、瘘管切开术、肛瘘切除术，在手术后还未恢复愈合，建议到医院复诊检查，进行换药治疗，了解手术创面愈合情况，保持大便通畅，忌酒辛辣食物，注意肛周清洁卫生。
到大医院检查并治疗，肛瘘是不会影响生育的，但是一定得积极治疗。建议可以去肛肠的医院进行手术治疗。平时注意做好预防，以免复发。饮食清淡，多喝水，多吃蔬菜，禁辛辣食物，适当运动。
忌食腥、辣刺激性食物。平素要多吃含纤维多的食物，如红薯、芹菜、茄子、香蕉、玉米等。用饮食调整的方法防止便秘，保持大便通畅，将有利于疾病的康复。避免久坐湿地，以免肛门部受凉受湿，引起感染。保持肛门清洁，勤换内裤，便后清洁肛门，对预防感染有积极作用。还有一点应该注意的是，一些药物和一些饮食是不能同时吃的。
高位肛瘘与低位肛瘘的区别在于，高位肛瘘是指瘘管已经到达坐骨直肠间隙、或者骨盆直肠间隙，低位肛瘘指瘘管的位置较浅，多在括约肌间隙、皮下脂肪间隙、或者是肛门后间隙。