先天性心脏病室间隔缺损的治疗原则主要是鉴于室缺有自然闭合的可能，因而对缺损小、年龄小的病儿可随诊观察至2岁-3岁的可以进行手术治疗，对于极小室缺、无症状、胸片、心电图均正常者，可以保守治疗。
先天性心脏病室间隔缺损的生存期尚不清楚，这与其损伤的严重程度和处理方法有关。间质缺损比较轻微，只要及时进行手术，基本不会对生命造成任何的损害，其生存期与正常人相当。如果出现严重的房间隔缺损，通过外科手术，患者的心脏机能可以恢复正常，但生存期要比普通人短一些。如果不及时有效地处理，可能导致心内膜炎等并发症，对儿童的生命和寿命造成极大的危害。
室间隔缺损小于0.1-0.3cm时没有任何临床表现其不需要特殊治疗，在1岁半左右可以自行修复。对于缺损比较严重的患儿采用介入治疗和手术治疗，药物治疗可以积极地防止感染性心内膜炎的发生，也可以防止心力衰竭的发生。进行手术治疗需要择期进行，最佳手术年龄在3岁左。
目前暂时是进行保守治疗，要避免感冒，引起病情加重，也要注意避免过度的熬夜和劳累，随着年龄的增长，要定期进行彩超的检查，如果七八岁的时候还没有愈合，可以选择进行微创手术治疗。
先天心脏病室间隔缺损是4mm，不严重属于轻度的，一定要遵医嘱进行控制，必要时做心脏搭桥手术，平时要多陪孩子聊聊天，带孩子出去旅游，散散步，放松心情，不要让孩子过于激动，饮食要清淡一些，多吃些水果蔬菜。
先天性心脏病如果在早期阶段没有发现症状，随着孩子的成长和发育，症状可以逐渐缓解。青少年最重要的临床表现是缺乏活动，据说先天性心脏病已被发现。早期手术治疗，术后恢复都比较好。