肾穿刺最严重的并发症就是肾脏的出血。
肾穿刺如同从头上取十几根头发，因为每人有两个肾脏，每个肾脏有100个肾单位，以此肾穿刺取10-20个肾单位，其对人的损害如同揪头发的损害一样。但是肾穿刺过程中可能会出血、感染、误穿其他脏器，造成肾脏出血。
建议一定要积极的进行肾穿刺，切不可因为害怕而拒绝做肾穿刺检查，不利于患者治疗。
做了肾穿刺的危害有穿刺后约80～90%有镜下血尿，肉眼血尿的发生率因穿刺针损伤程度而异，约5～50%。血尿在1～5天内自行消失。腰痛，肾穿刺术后，多数病人有同侧腰痛或不适感，约3～5天自行消失。感染，穿刺术后感染不是很多见，多因消毒不严或原有肾感染在穿刺后细菌扩散所致。
肾穿刺后想要上班要等到手术一个月之后。肾穿刺这种手术对身体的伤害是非常大的，如果在家里闲不住，可以稍微的活动一下，并且干一些比较轻松的工作，不要去过度劳累，应该躺在床上静养。
从前后入院检查到确定治疗方案出院，快的病人需要3天左右，慢的需要一周左右。肾穿刺完，为了让伤口少出血需要平躺6个小时左右不能动，只要不是限制喝水、水肿少尿的病人，要多喝水。
肾穿刺对身体没有影响，但是会出现局部出血、尿血等反应，或者肾周围的血肿，通常可自行恢复，若血肿较大，则可出现腰痛、腹痛等症状，严重时需输血治疗。极个别的在穿刺过程中划伤肾动脉或肾脏，导致大出血，需联合外科行肾切除术。
穿刺手术属于一种创伤性的活检手术，疼痛属于一种正常的现象，一般2到3天之后就会使疼痛得到缓解了，一周以后恢复正常，但是建议在三个月以内不要从事的重体力劳动注意休息。