服用紧急避孕药的副作用是恶心、神经性头痛、阴道不规则出血等。
由于紧急避孕药的成分为大量孕激素，因此人体摄入容易出现一定副作用，可能会对身体造成一定影响，因此紧急避孕药激素含量大，部分患者容易出现恶心、呕吐等不适症状，少部分人可能会出现神经性头痛，还可能导致阴道不规则出血、月经周期改变，不利于身体健康。因此建议遵医嘱适量使用紧急避孕药，并且最好不要选择这种方式避孕。
紧急避孕药应该在同房后72小时内服用，并且一般为空腹或饭后两小时后服用。
紧急避孕药是在同房后采取的避免非意愿妊娠的避孕措施。紧急避孕药建议在空腹或饭后两个小时使用，因为大多数避孕药都是通过胃溶解，可能会发生恶心、呕吐的情况，选择这个时间会减少药物有效成分的流失。而丹媚左炔诺孕酮肠溶片，可以通过肠溶解x吸收，降低恶心、呕吐情况的发生，副作用会小很多。
紧急避孕药内主要含有左炔诺孕酮，它可以抑制或延迟卵细胞的释放，从而达到避孕效果。紧急避孕药需要在无保护的同房发生后尽快服用，随时间的增加，避孕几率可能会有所降低。紧急避孕药只能作为预防怀孕的备用方法，不应用作常规的避孕措施。并且紧急避孕药不会一直维持避孕效果，如果使用者在服用紧急避孕药后再次发生了无保护性行为，则还是可能怀孕。
紧急避孕药是一种高效孕激素，一个月内如果吃了两次紧急避孕药，会引起内分泌失调、月经紊乱，可以出现不规则阴道流血，所以，这个药一年以内不能吃超过三次，一个月不能吃两次，如果吃了两次，造成的内分泌紊乱有可能很难纠正，有时候还会引起不排卵，出现不孕症。
药物可导致撤退性出血，这就是药物的副作用，出血时间未超过1周，则无需处理。
如果连续两个月以上还未发现流血症状，应该考虑妊娠了。可在性生活10天之后到医院复查有无妊娠。紧急避孕药的使用可引起最近月经紊乱和排卵不规则。如果出血时间较长，还会影响子宫内膜容受性及妊娠。因此，出血后并不存在一个绝对安全时期，同房无避孕措施，是不够安全。在这种情况下，要及时就医。
一般情况下，紧急避孕药属于激素类药物之一，副作用非常明显。这种副作用主要表现在胃肠道方面，如恶心、呕吐等症状。通常，服用紧急避孕药之后2小时就可以吃东西，但尽量以清淡的饮食为主。另外在服用紧急避孕药后，应该保持大便通畅，不要长期处于便秘状态下。紧急避孕药的使用时间不宜太长，以免影响药效，用药后，宜少饮水。
一个月之内只能吃一次紧急避孕药，一年之内不能超过三次，如果一个月之内吃了两次紧急避孕药，会导致月经不调，紊乱及不孕的可能。如果使用次数过多会导致一些副作用，比如不规则子宫出血，恶心呕吐，排卵期改变或者导致乳房胀痛，头晕，头痛，乏力等症状。还有可能会导致色素斑或者影响怀孕。