宫颈囊肿和卵巢囊肿，同为囊肿，其实并不相同。子宫颈囊肿是一种生理上的疾病，主要是由于一些腺管阻塞引起的，属于生理性的囊肿。卵巢囊肿属于子宫内的一种疾病，平时是看不到、摸不着的。目前人们所熟知的宫颈癌疫苗和HPV疫苗，主要用于治疗子宫颈疾病。子宫颈是一种非常常见的疾病，每年都会进行一次宫颈癌的检查，主要是通过以下常见的TCT、HPV检查来进行检查。如果是在子宫颈部，可以通过窥阴镜直接观察到。
卵巢癌属于卵巢恶性肿瘤，在早期常无症状。而卵巢癌一旦有不适症状，往往就属于晚期，比如会出现便秘，腹胀，或者自己摸到腹部包块。卵巢囊肿包括卵巢生理性囊肿，卵巢良性病理性囊肿以及卵巢恶性肿瘤。
卵巢囊肿是由卵巢局部的病理改变引起的，目前尚不明确。宫外孕指的是怀孕导致的一种异常现象，即是指妊娠囊在宫腔之外的地方生长、发育。这是两种疾病的根本不同，可以通过血液检测HCG来进行鉴别。宫外孕可以发生在卵巢、输卵管、宫颈部位、腹腔、盆腔内妊娠。一经发现应立即进行处置，否则将产生严重后果。如果是输卵管囊肿破裂或蒂扭转，则要择期手术。
附件囊肿是指卵巢囊肿，但彩色多普勒超声人员得出的结论不同。卵巢囊肿是妇科常见疾病。大多数都是煽动性的。一些小体积的囊肿会自行消失，无需吃药或手术。然而，一些体积大、直径超过5厘米的囊肿需要考虑手术治疗。
卵巢囊肿和卵泡组织结构和形态是完全不一样的卵泡属于生理排卵，囊肿属于病理性，女性因为工作不能有良好的饮食习惯，或生活习惯不好都是能导致体质过度酸化，人体的身体功会整体的下降，引起肾虚，最后导致卵巢疾病和内分泌失调，使之发展成为卵巢组织增生，导致囊肿的出现，这时就会对排卵造成很大影响。
盆腔囊肿和卵巢囊肿的区别在于：卵巢囊肿属于盆腔囊肿的一种，但盆腔囊肿不一定是卵巢囊肿。卵巢位于盆腔内，发生于卵巢的囊肿属于卵巢囊肿，也属于盆腔囊肿。如果病理性的卵巢囊肿不及时治疗，有可能导致卵巢的排卵功能异常，影响正常的生育功能。