最重要的是遗传因素。多囊卵巢有家族聚集性，与遗传相关，是常染色体显性遗传，或性染色体连锁显性遗传，或基因病变引起的疾病；环境因素：高雄激素会导致多囊卵巢综合征证候群。雌激素或雄激素的环境化合物如双酚A或二恶英等，会导致月经不调、不孕、多卵泡、高雄激素的症状。有学者发现部分药物，可能会导致睾酮及肥胖胰岛素明显升高。
造成多囊卵巢原因，肾上腺功能异常，女性若是出现肾上腺合成街体激素出现紊乱，会使得肾上腺皮质功能的过分亢进，从而造成过量的分泌雄激素，则会引起无排卵症状的出现，从而导致多囊卵巢的产生。下丘脑-垂体-卵巢轴功能异常。
多囊卵巢是由于丘脑下部-垂体-卵巢轴功能失调，破坏了相互之间的依赖与调节，因而卵巢长期不能排卵，是妇女常见的内分泌疾病且大多引起生殖障碍。到医院做个详细的检查，确诊病因，对症治疗。
内分泌失调，使得卵泡中的物质处于异常，无法正常发育，卵巢排卵也会出现问题，会有大量的分泌物流出，诱发多囊卵巢的发生。主要表现为稀发排卵或者不排卵，雄性激素增高，经过B超检查双侧卵巢呈多囊性改变，每个卵巢当中都有12个以上的卵泡，每个卵泡都不发育成熟，病人往往会有体重增加、多毛的现象。
多囊卵巢形成的原因，主要是平时内分泌失调造成的月经失调。遗传也是多囊卵巢的一个原因，再有就是平时经常吃膨化食品以及反季的蔬菜水果一类的都会造成现在的多囊卵巢的情况。长期处于精神紧张的状态以及受药物和某些疾病的影响，下丘脑一垂体一卵巢轴的调节功能会出现异常，导致卵巢间质、卵泡膜细胞产生过量雄激素。