晨起口苦多见于消化系统疾病，如胆囊炎等疾病，可以查腹部彩超、血常规、肝功能、肾功能等相关检查，以明确诊断，以免延误病情。如果经检查无器质性病变，则应该行中医治疗，从中医角度分析，口苦属于肝胆火盛或肝火反胃，胆腑以降为顺，胆汁味苦，肝火上溢，熏蒸胆汁上溢故见口苦。
早晨醒来口苦可能是由于药物、饮食刺激性、饮酒、休息不好等原因引起的。
这种情况可以通过停止用药、改变饮食习惯、避免酗酒、休息充足等方式自行恢复；如果症状没有缓解，可能是胃肠疾病、肝胆疾病等疾病引起的。此时则需患者及时到医院进行明确，并对症进行治疗。同时患者还需做好护理，保持饮食清淡，减少对口腔的刺激，对病症恢复有一定的帮助。
晨起时，觉得口苦的人很可能是口腔内发生病变，造成细菌滋生。
平时不注意口腔卫生，容易滋生牙菌斑，出现口臭、口苦等。牙龈、舌头、唾液腺等感染也可能导致口腔对味道的感觉异常。如果出现口干，那么一定要及时进行治疗和护理，否则会造成病情加重。还可能是体内肝火所致，或胃火旺，并且有的人肠道蠕动出现问题，还易引起肝火旺。另外，如果出现了上火的情况，会导致人们产生烦躁的情绪。并产生了这一现象，便要讲究饮食，把体内的火去掉，饮食力求清淡，才能去除体内肝火。
可能是由于消化系统，呼吸系统，心血管系统等出现了问题而引起的。同时口腔本身患有疾病，以及患有某些感染性疾病的人也可能会出现口苦。但是也不排除过度疲劳，睡眠不足，过度酗酒等引起的。
早上起来出现口苦的症状，有可能是由于口腔卫生不良，例如牙周病或者是出现了口干症所产生的。而且有一些人是由于抽烟的不良习惯，或者是胃肠生病了，也有可能是由于吃了特定异味的食物而产生的口苦的现象。
口苦多由于胆囊功能差，特别是胆囊疾病(胆囊炎、胆石症等)的病人的一种反应。还有一些由于胃动力差，食道存在炎症的人也可为胆汁反流至胃，也会引起口苦。另一方面，有的人生活不规律，睡眠休息不足，以及打呼噜，张口睡觉，口腔发炎等人群也易出现口苦的情况。做胃镜检查是否是有胆汁反流性胃炎的可能。检查清楚针对性的治疗。