新生儿母乳喂养拉肚子可以通过一般治疗、药物治疗等方式进行治疗。
新生儿母乳喂养腹泻，通常多因母体饮食不当引起。母乳中含有大量的维生素和蛋白质以及微量元素，这些营养物质都是对宝宝健康非常重要的成分。因此，母乳喂养过程中，妈妈要特别注意饮食，不能随意食用，不然肯定会造成儿童消化功能紊乱，继而发生腹泻。因此在母乳充足时，就应该尽量保证孩子摄入足够的食物，这样才能有效预防婴儿拉肚子。症状严重者，可让宝宝吃妈咪爱或益生菌调理肠胃，那么，平时就应该让孩子喝更多的水，帮助减轻患儿疾病。
三个月婴儿拉稀首先考虑是感染肠炎了，是一种消化功能紊乱的综合征，给孩子喝一些调节孩子肠道的菌群，同时也要给孩子多喝水，保证孩子体内充足的水分，避免孩子造成脱水的现象，注意孩子的保暖，避免孩子受凉加重病情，也要注意让孩子在饮食上做到少量多餐，避免孩子消化不良引起高烧，注意室内温度和湿度的适宜，充分保证宝宝的休息。
母乳喂养的宝宝拉肚子的情况，可能是由于着凉的情况导致的，或者是母乳出现了问题。在这段时间内给宝宝注意腹部的保暖，尽量避免着凉。然后平时一定要注意饮食安全，多喝水。
主要见于非感染性腹泻，有可能跟天气过凉、过热以及喂养不当关系最大。其次才是感染性腹泻，如果天气过凉，造成肠蠕动过快，孩子就容易拉水样大便或绿色大便，天气过热时消化酶分泌少，也容易造成消化不良。母乳喂养的小宝宝一定要注意妈妈的饮食，不要暴饮暴食，尤其天气热，妈妈容易上火，这时候要适当的清淡饮食，多喝水，不能吃油腻、刺激性、凉的食物。奶粉喂养的。宝宝要适当的多喝水。
刚出生的宝宝拉肚子不需要特殊处理的，只需要密切观察即可。观察宝宝的精神状态，吃奶情况，大便是否有恶臭，大便是否有粘液脓液血液等情况。如有以上问题应当及时就诊检查治疗的。
肠炎是微生物感染导致小肠及结肠炎症，婴幼儿常见疾病。
患有肠炎后会有腹痛、腹泻、呕吐的症状，重度肠炎还会有精神萎靡、轻度脱水、严重腹泻、电解质紊乱等症状。大部分的肠炎都是轻度的，宝宝患有肠炎导致腹泻不用急，先禁食4-6个小时，期间要多喝水。轻度肠炎2-3天就会自愈，若2天后症状加重要及时到医院治疗。