如果患有念珠菌性阴道炎应该使用药物治疗。
建议患者首先在阴道内放置制霉菌素阴道片，这种药物有很好的抑制念珠菌感染的效果，也可以选择保妇康栓，这种药物属于中成药制剂，能够抑制真菌感染。在治疗期间要让患者保持阴部清洁，避免发生性生活，避免吃辛辣刺激性的食物，否则很可能会诱发反复感染的，也可以口服一些抗真菌的药物，例如口服酮康唑等等。
念珠菌性阴道炎，又称阴道假丝酵母菌病，主要分为单纯型念珠菌性阴道炎，主要外用药物治疗，放置相关药物栓或者相关药物阴道栓，清洗外阴放入阴道内，此外要保持外阴清洁用药的时候禁止同房，复发型念珠菌性阴道炎，一般是连用三个月，每个月重复阴道放置相关药物栓一个星期后停药等下次来月经的干净三天再次放置相关药物栓，三个月后，来月经干净三天后复查白带常规，连续两次阴性为治好。
念珠菌性阴道炎连续治疗三周后基本恢复正常，治疗期间不要性生活，避免发生交叉感染。平时穿棉线宽松透气的内衣不要太紧身，养成良好的生活习惯，不要有多个性伴侣，避免感染性病。
用碱性溶液如2~4%碳酸氢钠或肥皂水冲洗外阴及阴道，改变阴道酸碱度，使不利于霉菌生长，冲洗后，再用制霉菌素片剂或栓剂塞入阴道内，每次10万~20万单位，每晚一次，10~14天为一疗程，外阴再涂以3%的消炎药，效果可更好。
如果只是在显微镜下发现了阴道念珠菌菌丝，没有任何的不适反应，并不需要进行任何处理。一般情况下，可以通过外用药膏来进行调理，但由于念珠菌性阴道炎的病情不同，治疗方法也不尽相同。如病人为复杂的念珠菌感染，一般需用药物超过2个疗程。妊娠期间有念珠菌感染，可以使用少量的外用药物，这样会更保险一些。
女性复发型的阴道念珠菌感染一般一年发生4次或4次。
霉菌性阴道炎属于白色念珠菌感染引起的一种比较顽固，容易反复的阴道炎，日常要特别注意会阴部的卫生。在治疗期间是也是要禁止性生活的。一般都是要治疗2周复查，如果白带正常了，才可以停药性生活的。