穿刺治疗巧克力囊肿属于微创治疗，费用通常需要5千元。导致卵巢囊肿的因素有很多，月经期、宫内手术感染和下丘脑-垂体-卵巢轴功能异常等都会导致卵巢囊肿。遵医嘱治疗，不要急躁。
巧克力囊肿手术可以选择开腹及腹腔镜两种。如果是开腹手术需要5千元-6千元；如果是选择微创手术腹腔镜，费用要高些7千元-9千元；因为巧克力囊肿的特殊性，术后是需要服用药物或是打针防止复发的。根据做的方法不同费用5千元-8千元；术后需要应用防止复发的药物。
巧克力囊肿腹腔镜手术费用大约需要一万到一万五左右。不同的医院收费会有所不同，不同的地区收费也会有所差异。一般三甲医院的收费高于二甲医院，发达地区的收费高于落后地区。巧克力囊肿腹腔镜的手术还要根据手术时间的长短，以及手术的难易程度、术中腹腔是否有粘连以及麻醉药的用药多少、监护的时间等，考虑手术的费用综合。
巧克力囊肿是由于子宫内膜异位症导致的，是因为一位的子宫内膜随着月经周期发生周期性出血，但是血液无法正常排出，所以局部会出现肿大和疼痛，囊肿内的血液因为长期不能排出呈巧克力状。巧克力囊肿一般选择的是腹腔镜手术切除，属于微创手术，术后身体恢复较快，费用2千-3千元。
手术一般有两种方式，开腹和腹腔镜。传统的开腹手术费用较低，3000元-5000元左右，但是创伤大，需要的恢复时间较长；腹腔镜手术创伤小，术后恢复快，费用总计约7000元-9000元左右，但是术后容易引起粘连。
巧克力囊肿及时进行治疗，也是可以恢复正常的，关于治疗的方法不同，各级医院的收费标准也不同，不容易确定具体的费用。如果现在囊肿比较小，可以服用中药进行调理，一般的费用大约几百元就可以，如果现在囊肿比较大，就需要做腹腔镜微创手术治疗，一般的费用大约几千元。